Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00581
• Subject: NM_010231.3
• Aligned Length: 1601
• Identities: 1360
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74
            ||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGTGAAGCGAGTGGCAATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGCCTGGAAGAGGG  74

Query   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG  148
            .|||||||||||||||||.|||||||||..||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGGAGCCCACCTGCTTCGAGAGGAGCAGTGACCTGGGGGGACTTTGGAGATTCACGGAACATGTTGAAGAAG  148

Query  149  GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC  222
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||||.||||||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  GGAGAGCCAGTCTTTACAAGTCTGTGGTTTCTAACAGCAGCAGGGAGATGTCGTGTTACCCAGATTTTCCTTTT  222

Query  223  CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA  296
            ||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.||..|
Sbjct  223  CCAGAAGACTATCCAAACTTTGTGCCAAATTCTCTATTCCTGGAATATCTCAAACTCTACTCAACCCAGTTCAA  296

Query  297  CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC  370
            |||||.||.|..||||.|.|||||.||||||||.||||||.||||||||.||.|.||||.||||||||||||.|
Sbjct  297  CCTTCAGAGATGCATTTATTTCAATACCAAAGTGTGCAGTATAACAAAACGCCCGGATTTTGCTGTCTCTGGAC  370

Query  371  AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAA-GAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGG  443
            |.|||||.|||||||||.| ||..|| |.|||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGGGAAGTGGTCACTGT-CACAAACGGGAAGCAAAACTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGG  443

Query  444  CTTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTAT--TAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCA  515
            .|||||.|||||.||..||.||||.|||||||||||.||||||||  |||  |.|||||.||..|||||||.||
Sbjct  444  TTTTCTAACTAACCCACATCTGCCCCTGGATTCCTTCCCAGGTATACTAA--CTTTTAAGGGGGAGTACTTCCA  515

Query  516  TAGCCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCA  589
            .|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct  516  CAGCCGACAGTATAAACATCCAGACATATTTAAGGACAAGCGAGTCCTTGTAGTTGGAATGGGGAATTCTGGCA  589

Query  590  CAGACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATC  663
            ||||.|||||.|||||||||||||||.|.||..|||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||
Sbjct  590  CAGATATTGCCGTGGAGGCCAGCCACTTAGCAAAAAAGGTGTTCCTCAGCACTACTGGAGGGGCATGGGTGATC  663

Query  664  AGCCGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTC  737
            ||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||.|.||||||..
Sbjct  664  AGCCGAGTCTTTGATTCAGGGTACCCATGGGACATGATATTCATGACACGATTTCAGAACATGCTCAGAAATCT  737

Query  738  CCTCCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGC--GAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGG  809
            .||||||||.||||||||||.|||||||||  |.|  .||||||.||||.||||.||||.||.|..||||||||
Sbjct  738  TCTCCCAACTCCAATTGTGAGTTGGTTGAT--ATCAAAAAAGATGAACAGCTGGTTCAACCACGTGAATTACGG  809

Query  810  CTTAATACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTG  883
            ..||...||||||||||||||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  810  TGTAGCTCCAGAAGACAGGACTCAGCTGAGAGAGCCTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGCCGCATCATCACTG  883

Query  884  GGAAAGTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAA  957
            ||||||||||.||||.|||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||..|||||||.
Sbjct  884  GGAAAGTGTTTATCAAGCCCAGCATCAAGGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCGTGTTCAACAACACACCAAAGGAG  957

Query  958  GAGCCTATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAA  1031
            |||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  958  GAGCCCATTGACATCATCGTCTTTGCGACTGGATATACTTTTGCGTTCCCCTTCCTCGATGAATCCGTAGTGAA  1031

Query 1032  AGTTGAAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTA  1105
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||.|||||.|||||..|.|
Sbjct 1032  AGTTGAGGATGGCCAGGCATCACTGTACAAGTACATCTTCCCTGCGCATCTGCCAAAACCAACTCTGGCTGTGA  1105

Query 1106  TTGGCCTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTG  1179
            |||||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.||||.|||||..|||||.
Sbjct 1106  TTGGCCTCATCAAGCCCCTGGGCTCCATGGTACCCACAGGAGAGACACAAGCTCGATGGGTTGTTCAGGTCCTA  1179

Query 1180  AAAGGTGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAG  1253
            |||||||.||.||..||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||.|.||||..|||||||||..||
Sbjct 1180  AAAGGTGCAACTACATTACCACCGCCAAGTGTCATGATGGAGGAAGTTAATGAACGGAAGAAAAACAAGCATAG  1253

Query 1254  TTGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTATA  1327
            ..||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||
Sbjct 1254  CGGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTGCAAACAGATTATATAACATACATAGATGACCTCCTGACCTCTA  1327

Query 1328  TCAATGCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCCA  1401
            ||||.||||||||..|.|||....|.||||||||.||.||.||||..||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1328  TCAACGCAAAACCGGATCTGCGGGCCATGCTCCTGACTGACCCACGACTGGCTCTGAGCATCTTCTTTGGCCCA  1401

Query 1402  TGCTCACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGTG  1475
            ||..|.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1402  TGTACCCCTTACCATTTCCGCCTGACTGGTCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAAGGCCATCTTGACCCAGTG  1475

Query 1476  GGACCGAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAAG  1549
            ||||||||||.|.||.||||.||||.|||||....|||||||.||.||||||.|||||||||.|||.||.|||.
Sbjct 1476  GGACCGAACAGTGAAAGTCACCAAAACTCGAACCATACAAGAATCCCCATCTTCCTTTGAAACTTTGCTGAAAC  1549

Query 1550  TCTTTAGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1596
            |||||||.||||||||||||||..|.|||.|.||..||||||||||.
Sbjct 1550  TCTTTAGTTTTCTGGCTTTGCTCATAGCTGTCTTCTTGATTTTCCTG  1596