Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00581
• Subject: XM_005245037.3
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1296
• Gaps: 300

Alignment

Query    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA  296
                                                                      |||      |.|.|||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATG------ATTGTGA  10

Query  297  -CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAG-----ACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCT  364
             .||||     |.||..||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  GGCTTC-----CCCAGCCA---CAAGGAACTACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCT  76

Query  365  CTGGCCAATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  CTGGCCAATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGC  150

Query  439  ACTGGCTTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTT  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151  ACTGGCTTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTT  224

Query  513  TCATAGCCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  TCATAGCCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTG  298

Query  587  GCACAGACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTG  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  GCACAGACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTG  372

Query  661  ATCAGCCGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAA  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  ATCAGCCGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAA  446

Query  735  TTCCCTCCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  TTCCCTCCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACG  520

Query  809  GCTTAATACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACT  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  GCTTAATACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACT  594

Query  883  GGGAAAGTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGA  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GGGAAAGTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGA  668

Query  957  AGAGCCTATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  AGAGCCTATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGA  742

Query 1031  AAGTTGAAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  AAGTTGAAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATT  816

Query 1105  ATTGGCCTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCT  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  ATTGGCCTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCT  890

Query 1179  GAAAGGTGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  GAAAGGTGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCA  964

Query 1253  GTTGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTAT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  GTTGGTTTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTAT  1038

Query 1327  ATCAATGCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  ATCAATGCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCC  1112

Query 1401  ATGCTCACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGT  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  ATGCTCACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGT  1186

Query 1475  GGGACCGAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAA  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  GGGACCGAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAA  1260

Query 1549  GTCTTTAGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  GTCTTTAGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1308