Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00581
• Subject: XM_005245038.4
• Aligned Length: 1596
• Identities: 1233
• Gaps: 363

Alignment

Query    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG  74

Query   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG  148

Query  149  GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC  222

Query  223  CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA  296

Query  297  CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC  370

Query  371  AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC  444

Query  445  TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG  518

Query  519  CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG  592

Query  593  ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC  666

Query  667  CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT  740

Query  741  CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA  814

Query  815  TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA  888

Query  889  GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC  962

Query  963  TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG  1036

Query 1037  AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC  1110

Query 1111  CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1111  CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAA--  1182

Query 1185  TGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAGTTGGT  1258
                                                                                   |||
Sbjct 1183  -----------------------------------------------------------------------GGT  1185

Query 1259  TTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTATATCAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 1186  TTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACA--------------------------  1233

Query 1333  GCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCCATGCTC  1406
                                                                                      
Sbjct 1234  --------------------------------------------------------------------------  1233

Query 1407  ACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGTGGGACC  1480
                                                                                      
Sbjct 1234  --------------------------------------------------------------------------  1233

Query 1481  GAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAAGTCTTT  1554
                                                                                      
Sbjct 1234  --------------------------------------------------------------------------  1233

Query 1555  AGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA  1596
                                                      
Sbjct 1234  ------------------------------------------  1233