Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00581
- Subject:
- XM_006711242.4
- Aligned Length:
- 1596
- Identities:
- 1254
- Gaps:
- 342
Alignment
Query 1 ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAAGCGAGTTGCCATTGTGGGAGCTGGGGTCAGCGGCCTGGCCTCCATCAAGTGCTGTCTGGAAGAAGG 74
Query 75 ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGGAGCCCACCTGCTTTGAGAGGAGCGATGACCTTGGGGGGCTGTGGAGATTCACCGAACATGTTGAAGAAG 148
Query 149 GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGAGCCAGTCTCTACAAGTCTGTGGTTTCCAACAGCTGCAAGGAGATGTCTTGTTACTCAGACTTTCCATTC 222
Query 223 CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGAAGATTATCCAAACTATGTGCCAAATTCTCAATTCCTGGAATATCTCAAAATGTATGCAAACCACTTTGA 296
Query 297 CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTTCTGAAACACATTCAATTCAAGACCAAAGTCTGCAGTGTAACAAAATGCTCAGATTCTGCTGTCTCTGGCC 370
Query 371 AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATGGGAGGTGGTCACTATGCATGAAGAGAAGCAAGAGTCAGCCATCTTTGATGCTGTCATGGTCTGCACTGGC 444
Query 445 TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCTTACTAATCCTTATTTGCCACTGGATTCCTTTCCAGGTATTAATGCCTTTAAAGGCCAGTACTTTCATAG 518
Query 519 CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGGCAATATAAGCATCCAGATATATTTAAGGACAAGAGAGTCCTTGTGATTGGAATGGGAAATTCTGGCACAG 592
Query 593 ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATTGCTGTGGAGGCCAGCCACCTGGCGGAAAAGGTGTTCCTCAGCACCACCGGAGGGGGATGGGTGATCAGC 666
Query 667 CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGAATCTTTGACTCGGGCTACCCATGGGACATGGTGTTCATGACACGCTTTCAGAACATGTTGAGAAATTCCCT 740
Query 741 CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCAACCCCAATTGTGACTTGGTTGATGGAGCGAAAGATAAACAACTGGCTCAATCATGCAAATTACGGCTTAA 814
Query 815 TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TACCAGAAGACAGGACTCAGCTGAAAGAGTTTGTGCTAAATGATGAGCTCCCAGGACGCATCATCACTGGGAAA 888
Query 889 GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGTTCATCAGGCCAAGCATAAAAGAGGTAAAGGAAAACTCTGTCATATTTAACAATACTTCAAAGGAAGAGCC 962
Query 963 TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATTGACATCATTGTCTTTGCCACTGGATACACATTTGCTTTCCCCTTCCTTGATGAGTCTGTAGTGAAAGTTG 1036
Query 1037 AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGATGGCCAGGCCTCACTGTACAAGTATATCTTCCCTGCACATCTGCAAAAGCCAACCCTGGCCATTATTGGC 1110
Query 1111 CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTCATCAAACCCTTGGGCTCCATGATACCTACAGGAGAAACACAAGCTCGGTGGGCTGTTCGAGTCCTGAAAGG 1184
Query 1185 TGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAGTTGGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTAAATAAGTTACCACCACCAAGTGTCATGATAGAGGAAATTAATGCAAGGAAAGAAAACAAGCCCAGT---- 1254
Query 1259 TTGGCTTGTGCTACTGCAAGGCTTTACAATCAGATTATATCACATACATAGATGAACTCCTGACCTATATCAAT 1332
Sbjct 1255 -------------------------------------------------------------------------- 1254
Query 1333 GCAAAACCCAACCTGTTCTCTATGCTCCTAACGGATCCACATCTGGCTCTGACCGTCTTCTTTGGCCCATGCTC 1406
Sbjct 1255 -------------------------------------------------------------------------- 1254
Query 1407 ACCATACCAGTTCCGCTTGACTGGCCCAGGAAAATGGGAAGGAGCCAGAAATGCCATCATGACCCAGTGGGACC 1480
Sbjct 1255 -------------------------------------------------------------------------- 1254
Query 1481 GAACATTCAAGGTCATCAAAGCTCGAGTTGTACAAGAGTCTCCATCTCCCTTTGAAAGTTTTCTTAAAGTCTTT 1554
Sbjct 1255 -------------------------------------------------------------------------- 1254
Query 1555 AGCTTTCTGGCTTTGCTTGTGGCTATTTTTCTGATTTTCCTA 1596
Sbjct 1255 ------------------------------------------ 1254