Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00590
• Subject: NM_010237.3
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1327
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGAGCAACATCTGTCAGAGGCTCTGGGAGTACCTAGAACCCTATCTCCCCTGTTTGTC-CACGGAGGCAGACA  73
            |||.|||.|.|||||..|||.|||||||..|||||..|.||.|.||||||.||.|.||| || .||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGCGTCTGTGTGAGACTCTGGGCATACCTGCAGCCTTTTCTCCCGTGCTGGTCTCA-AGAGGCAGACA  73

Query   74  AGTCAACCGTGATTGAAAATCCAGGGGCCCTTTGCTCTCCCCA-----------GTCACA------------GA  124
            |||||...||.|||||.||||||||||||.|.|| || |||||           ||||||            .|
Sbjct   74  AGTCAGTAGTAATTGAGAATCCAGGGGCCTTCTG-TC-CCCCAGAGGCTCCCAGGTCACAAGAGCCCGAGAGAA  145

Query  125  GGCATGGCCACTACTTTGTGGCTTTGTTTGATTACCAGGCTCGGACTGCTGAGGACTTGAGCTTCCGAGCAGGT  198
            |.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.||||||.||||||||||.||.||.
Sbjct  146  GCCATGGCCAGTATTTTGTGGCTCTGTTTGATTACCAAGCACGTACTGCAGAGGACCTGAGCTTCCGTGCCGGC  219

Query  199  GACAAACTTCAAGTTCTGGACACTTTGCATGAGGGCTGGTGGTTTGCCAGACACTTGGAGAAAAGACGAGA--T  270
            ||||||||.|||||..|||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||  ||||.|.||  .
Sbjct  220  GACAAACTCCAAGTCTTGGACACTTCGCATGAGGGCTGGTGGTTGGCCAGACATTTGGAG--AAGAAGGGAACC  291

Query  271  GGCTCCAGTCAGCAACTACAAGGCTATATTCCTTCTAACTACGTGGCTGAGGACAGAAGCCTACAGGCAGAGCC  344
            ||||...|||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||.|.||.||.|||||||||||
Sbjct  292  GGCTTAGGTCAGCAGCTACAGGGCTACATTCCTTCCAATTACGTGGCGGAGGACCGGAGTCTCCAGGCAGAGCC  365

Query  345  GTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGATCAGATGCAGAGAAACAACTATTATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCT  418
            ||||||.||||||||||||..||||.||||||||||.||||||||..|.||||||||||||.||||.||..|||
Sbjct  366  GTGGTTTTTTGGAGCAATCAAAAGAGCAGATGCAGAAAAACAACTTCTGTATTCAGAAAACCAGACGGGCGCCT  439

Query  419  TTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGCCAAAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGTTTTAGATGGAGCAGTTGTAAAACAC  492
            |||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||.||..||||||||||||
Sbjct  440  TTCTAATCAGAGAGAGTGAGAGCCAGAAGGGTGACTTTTCCCTCTCAGTTTTAGATGAAGGTGTTGTAAAACAC  513

Query  493  TACAGAATTAAAAGACTGGATGAAGGGGGATTTTTTCTCACGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATT  566
            ||||||||.|.|||..||||||||||.||.||.||.|||||..|.||.|.|.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  514  TACAGAATAAGAAGGTTGGATGAAGGTGGCTTCTTCCTCACCAGGAGGAAAGTCTTTTCAACCCTGAATGAATT  587

Query  567  TGTGAGCCACTACACCAAGACAAGTGACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGATCCAGGTCC  640
            .||||.|.|||||||||..|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  588  CGTGAACTACTACACCACAACAAGTGACGGGCTGTGTGTCAAGCTGGAGAAGCCATGCTTAAAGATCCAGGTAC  661

Query  641  CAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAAAACCGTGGACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAG  714
            ||.|.||.|||||||||||.||||||||.|..|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  662  CAACCCCTTTTGATTTGTCATATAAAACTGCAGACCAGTGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTTTGAAG  735

Query  715  CGATTGGGATCTGGTCAGTTTGGCGAAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCCAGTAGCAGTGAAAAC  788
            |||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  736  CGACTGGGATCTGGTCAGTTTGGAGAAGTTTGGGAAGGTCTGTGGAATAATACCACTCCAGTGGCCGTAAAAAC  809

Query  789  ATTAAAACCAGGTTCAATGGATCCAAATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAA  862
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  810  GTTAAAACCAGGTTCAATGGATCCAAATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAGCCTAAGACACCCAA  883

Query  863  AGCTTATCCAGCTTTATGCTGTTTGCACTTTAGAAGATCCAATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGA  936
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  AACTCATCCAGCTCTATGCTGTTTGCACTTTAGAAGATCCCATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGA  957

Query  937  AGTCTGCAAGAATATCTCCAAAATGACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCGGCACA  1010
            ||.|||||||||||||||||||||||...|||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  AGCCTGCAAGAATATCTCCAAAATGATGGTGGGTCAAAAATCCATTTGATTCAACAGGTAGACATGGCGGCACA  1031

Query 1011  GGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTGGAGTCTCGGAACTACATTCACAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCG  1084
            |||.||.|||||||||||||||||.|||||.|.||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1032  GGTGGCTTCTGGAATGGCCTATCTTGAGTCGCAGAACTATATTCACAGAGATCTGGCTGCAAGAAATGTCCTTG  1105

Query 1085  TTGGTGAACATAATATCTACAAAGTAGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATC  1158
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  TTGGTGAACATAATATCTACAAAGTAGCAGATTTTGGACTTGCAAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATC  1179

Query 1159  TATGAATCTAGACACGAAATAAAGCTGCCGGTGAAGTGGACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAG  1232
            ||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1180  TATGAATCTAAACACGAAATAAAGCTGCCAGTGAAGTGGACTGCACCCGAAGCCATTCGTACTAATAAATTCAG  1253

Query 1233  CATTAAGTCCGATGTATGGTCATTTGGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTG  1306
            |||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CATTAAGTCTGATGTGTGGTCTTTTGGAATCCTGCTCTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTG  1327

Query 1307  GTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCAGATGTTGGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAG  1380
            |||||||||||||.||.|||||.||.||||||..|||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1328  GTATGACAGGTGCTCAAGTAATTCAAATGTTGAGTCAAAACTACAGACTTCCACAGCCATCTAACTGCCCACAG  1401

Query 1381  CAATTTTACAACATCATGTTGGAGTGCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACATTTGAGACACTGCGTTG  1454
            |||||.||||.|||||||.|.|||||||||||||..|||||||||.||||.||.|||||||||||.||||.|||
Sbjct 1402  CAATTCTACAGCATCATGCTAGAGTGCTGGAATGTTGAGCCTAAGCAACGGCCAACATTTGAGACCCTGCATTG  1475

Query 1455  GAAACTTGAAGACTATTTTGAAACAGACTCTTCATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA-  1515
            |||||||||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||| | 
Sbjct 1476  GAAACTTGAAGACTACTTTGAAACAGACTGTTCCTATTCAGATACAAATAACTTCATAA-AC  1536