Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_00651
Subject:
NM_010306.3
Aligned Length:
1062
Identities:
993
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAAGACAAGGCGGCAGTGGAGCGAAGCAAGATGATCGACCGCAACTTACGGGA  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGCAAGATGATCGACCGCAACTTGCGGGA  74

Query   75  GGACGGGGAAAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTACTCGGTGCTGGAGAATCTGGTAAAAGCACCATTG  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  GGACGGGGAGAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTGCTCGGCGCTGGAGAATCTGGTAAAAGTACCATCG  148

Query  149  TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGATGGCTATTCAGAGGATGAATGTAAACAATATAAAGTAGTTGTCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGACGGCTATTCAGAGGACGAATGTAAACAGTATAAAGTAGTTGTCTAC  222

Query  223  AGCAATACTATACAGTCCATCATTGCAATCATAAGAGCCATGGGACGGCTAAAGATTGACTTTGGGGAAGCTGC  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  223  AGCAATACTATTCAGTCCATCATTGCAATCATACGAGCCATGGGACGGTTGAAGATTGATTTTGGGGAATCTGC  296

Query  297  CAGGGCAGATGATGCCCGGCAATTATTTGTTTTAGCTGGCAGTGCTGAAGAAGGAGTCATGACTCCAGAACTAG  370
            |||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  297  CAGAGCAGATGATGCCCGACAGTTATTTGTTTTAGCTGGGAGTGCTGAAGAAGGAGTCATGACTTCAGAACTAG  370

Query  371  CAGGAGTGATTAAACGGTTATGGCGAGATGGTGGGGTACAAGCTTGCTTCAGCAGATCCAGGGAATATCAGCTC  444
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGCGTGATTAAACGTTTATGGCGAGATGGCGGGGTACAGGCATGCTTTAGCAGGTCCAGGGAATATCAGCTC  444

Query  445  AATGATTCTGCTTCATATTATCTAAATGATCTGGATAGAATATCCCAGTCTAACTACATTCCAACTCAGCAAGA  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGATTCTGCTTCATACTACCTAAATGATTTGGATAGAATATCCCAGACCAACTACATTCCAACTCAGCAAGA  518

Query  519  TGTTCTTCGGACGAGAGTGAAGACCACAGGCATTGTAGAAACACATTTCACCTTCAAAGACCTATACTTCAAGA  592
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct  519  TGTTCTTCGGACAAGAGTGAAGACTACAGGCATTGTGGAGACCCACTTCACCTTCAAGGAACTCTACTTCAAAA  592

Query  593  TGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCAGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTATC  666
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCCGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTATC  666

Query  667  TTCTGTGTGGCCCTCAGTGATTATGACCTTGTTCTGGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGAATGCATGAAAGCAT  740
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTTGTGTGGCTCTCAGTGATTACGACCTTGTTCTGGCTGAGGATGAGGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCAT  740

Query  741  GAAACTGTTTGACAGCATTTGTAATAACAAATGGTTTACAGAAACTTCAATCATTCTCTTCCTTAACAAGAAAG  814
            ||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  GAAATTGTTTGACAGCATTTGTAACAACAAATGGTTTACAGACACTTCAATCATTCTCTTTCTTAATAAGAAAG  814

Query  815  ACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCGTTAACTATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACATAT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  ACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCATTAACAATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACATAC  888

Query  889  GAAGAGGCAGCTGCCTATATTCAATGCCAGTTTGAAGATCTGAACAGAAGAAAAGATACCAAGGAGATCTATAC  962
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct  889  GAAGAGGCAGCTGCTTACATTCAGTGCCAGTTTGAAGATCTGAACCGAAGAAAAGATACCAAGGAGGTCTACAC  962

Query  963  TCACTTCACCTGTGCCACAGACACGAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACAGATGTCATCATTAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  TCACTTCACCTGTGCCACAGACACCAAAAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACGGATGTCATCATTAAAA  1036

Query 1037  ACAACTTAAAGGAATGTGGACTTTAT  1062
            |||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  ACAACTTAAAGGAATGTGGGCTTTAT  1062