Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00684
• Subject: XM_017314684.1
• Aligned Length: 1210
• Identities: 892
• Gaps: 233

Alignment

Query    1  ATGCCCGCACTCCTGGAGCGCCCCAAGCTTTCCAACGCCATGGCCAGGGCGCTGCACCGGCACATTATGATGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCCGCACTCCTGGAGCGCCCCAAGCTTTCCAACGCTATGGCCAGGGCTCTGCACCGGCACATCATGATGGA  74

Query   75  GCGGGAGCGCAAGCGGCAGGAGGAAGAAGAGGTGGATAAGATGATGGAACAGAAGATGAAGGAAGAACAGGAGA  148
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  GCGGGAGCGCAAACGGCAGGAGGAGGAAGAGGTGGACAAGATGATGGAACAGAAGATGAAAGAAGAGCAGGAGA  148

Query  149  GAAGGAAGAAAAAGGAGATGGAAGAGAGAATGTCATTAGAGGAGACCAAGGAACAAATTCTGAAGTTGGAGGAG  222
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||.||.|||||
Sbjct  149  GAAGAAAGAAAAAGGAAATGGAAGAGAGAATGTCACTAGAGGAGACCAAGGAACAGATCCTGAAGCTGCAGGAG  222

Query  223  AAGCTTTTGGCTCTACAGGAAGAGAAGCACCAGCTTTTCCTGCAGCTCAAGAAAGTTTTACATGAGGAAGAAAA  296
            |||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCTTTCTGCTCTACAGGAGGAGAAGCACCAGCTTTTCTTGCAGCTCAAGAAAGTTTTGCATGAGGAAGAAAA  296

Query  297  ACGGAGGCGAAAGGAACAGAGTGACCTGACCACCCTAACATCAGCTGCATACCAGCAGAGCCTGACTGTTCACA  370
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  ACGGAGGCGAAAGGAACAGAGTGACTTAACCACTCTGACATCAGCTGCATACCAGCAGAGCCTGACGGTTCATA  370

Query  371  CAGGAACTCATCTCCTCAGCATGCAGGGGAGCCCTGGAGGACACAATCGCCCAGGCACCCTCATGGCAGCTGAC  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  371  CAGGAACCCACCTCCTCAGCATGCAGGGGAGCCCTGGAGGACACAATCGCCCAGGTACTCTGATGGCAGCTGAC  444

Query  445  AGAGCCAAACAAATGTTTGGACCCCAAGTGCTTACGACCCGGCACTACGTGGGCTCAGCAGCTGCTTTTGCAGG  518
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAGCCAAGCAGATGTTTGGACCACAAGTGCTTACGACCCGGCACTACGTGGGATCAGCAGCTGCTTTTGCAGG  518

Query  519  GACACCAGAGCATGGACAATTCCAAGGCAGTCCTGGTGGTGCCTATGGGACTGCTCAGCCCCCACCTCACTATG  592
            .||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AACCCCAGAACATGGACAATTCCAAGGCAGTCCAGGGGGTGCTTATGGGACTGCTCAGCCCCCACCTCATTATG  592

Query  593  GGCCCACACAGCCAGCTTATAGTCCTAGTCAGCAGCTCAGAGCTCCTTCGGCATTCCCTGCAGTGCAGTACCTA  666
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCCAACACAACCAGCCTATAGTCCTAGCCAGCAGCTCAGAGCCCCATCAGCATTTCCTGCAGTGCAGTACCTA  666

Query  667  TCTCAGCCACAGCCACAGCCCTATGCTGTGCATGGCCACTTTCAGCCCACTCAGACAGGT--------------  726
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct  667  TCTCAGCCACAGCCACAACCCTATGCAGTGCATGGCCACTTTCAGCCCACTCAGACAGGTGAGATCCCCCTGGG  740

Query  727  ----------------------------------------------------------------TTCCTCCAGC  736
                                                                            ||||||||||
Sbjct  741  CAGGAGCCCTACCTTCAGGAGTCCTACTGCCACCTGCTCATTTCAAACTCTCCTCCCCTCAGGGTTCCTCCAGC  814

Query  737  CTGGTGGTGCCCTGTCCTTGCAAAAGCAGATGGAACATGCTAACCAGCAGACTGGCTTCTCCGACTCATCCTCT  810
            |.||..||.||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  CCGGCAGTACCCTCTCTTTGCAGAAACAGATGGAGCATGCCAACCAGCAGACCAGCTTCTCGGACTCATCTTCT  888

Query  811  CTGCGCCCCATGCACCCCCAGGCTCTGCATCCAGCCCCTGGACTCCTTGCTTCCCCCCAGCTCCCTGTGCAGAT  884
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  889  CTGCGGCCCATGCACCCCCAAGCTCTGCATCCAGCCCCTGGACTCCTGGCTTCCCCCCAGCTTCCCGTACAGAT  962

Query  885  GCAGCCAGCAGGAAAGTCGGGCTTTGCAGCTACCAGCCAACCTGGCCCTCGGCTCCCCTTCATCCAACACAGCC  958
            .||..|||||||.||    ||||||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAAGCAGCAGGGAA----GGCTTTGCCACCACCAGCCAACCTGGCCCCCGACTCCCTTTCATCCAACACAGCC  1032

Query  959  AGAACCCGCGATTCTACCACAAG---------------------------------------------------  981
            |||||||..|||||||.||||||                                                   
Sbjct 1033  AGAACCCAAGATTCTATCACAAGTAACCACCAGAGAGCTCCAGCCCACCCTCCATCCCTCAGGCTGGGGTCTTA  1106

Query  982  --------------------------------------------------------------------------  981
                                                                                      
Sbjct 1107  TGTGCCCCAAACCAATAAAATGTACAAAATGTACCCACCATCATGCCTGAGTGCTGTTTATTTGCTTCCTATCC  1180

Query  982  --------------------------  981
                                      
Sbjct 1181  AACTGCCTAAACCACAAAGGCTACTA  1206