Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00692
• Subject: XM_006521249.3
• Aligned Length: 1114
• Identities: 937
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ATGTCCCATGAAAAGAGTTTTTTGGTGTCTGGGGACAACTATCCTCCCCCCAACCCTGGATATCCGGGGGGGCC  74
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..||||||||||..|||..|         |.||||||
Sbjct    1  ATGTCCCATGAAAAGAGTTTCTTGGTGTCTGGGGACAGTTATCCTCCCCAAAACATT---------GTGGGGCC  65

Query   75  CC-AGCCACCCATGCCCCCCTATGCTCAGCCTCCCTACCCTGGGGCCCCTTACCCACAGCCCCCTTTCCAGCCC  147
            || |||| ||.|||||.|||||||.||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct   66  CCAAGCC-CCTATGCCTCCCTATGTTCAGGCTCCCTACCCTGGGGCCCCATACCCACAGGCCCCTTTCCAGCCC  138

Query  148  TCCCCCTACGGTCAGCCAGGGTACCCCCATGGCCCCAGCCCCTACCCCCAAGGGGGCTACCCACAGGGTCCCTA  221
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||               |||.|||||||||     
Sbjct  139  TCTCCCTATGGTCAGCCAGGATATCCCCATGGTCCCAGCCC---------------CTATCCACAGGGT-----  192

Query  222  CCCCCAAGGGGGCTACCCACAGGGCCCCTACCCACAAGAGGGCTACCCACAGGGCCCCTACCCCCAAGGGGGCT  295
                                                    ||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  193  ----------------------------------------GGTTACCCTCAAGGGCCCTACCCTCAAGGAGGCT  226

Query  296  ACCCCCAGGGGCCATATCCCCAGAGCCCCTTCCCCCCCAACCCCTATGGACAGCCACAGGTCTTCCCAGGACAA  369
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||....||||      ||.
Sbjct  227  ACCCACAGGGGCCATACCCACAGAGCCCCTTCCCGCCCAACCCCTATGGACAGCCACCACCCTTC------CAG  294

Query  370  GACCCTGACTCACCCCAGCATGGAAACTACCAGGAGGAGGGTCCCCCATCCTACTATGACAACCAGGACTTCCC  443
            |||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GACCCTGGCTCACCTCAGCATGGGAACTACCAGGAGGAAGGGCCTCCATCCTACTATGACAACCAGGACTTCCC  368

Query  444  TGCCACCAACTGGGATGACAAGAGCATCCGACAGGCCTTCATCCGCAAGGTGTTCCTAGTGCTGACCTTGCAGC  517
            |||...|||||||   |||||||.|||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  369  TGCTGTCAACTGG---GACAAGAACATTCGCCAGGCCTTTATCAGAAAGGTGTTCCTGGTGCTGACCCTGCAGC  439

Query  518  TGTCGGTGACCCTGTCCACGGTGTCTGTGTTCACTTTTGTTGCGGAGGTGAAGGGCTTTGTCCGGGAGAATGTC  591
            |||||||||||||||||||.|||.|..|.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  TGTCGGTGACCCTGTCCACTGTGGCCATTTTCACTTTTGTTGGGGAGGTGAAGGGCTTTGTCCGGGAGAATGTC  513

Query  592  TGGACCTACTATGTCTCCTATGCTGTCTTCTTCATCTCTCTCATCGTCCTCAGCTGTTGTGGGGACTTCCGGCG  665
            ||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  TGGACCTACTATGTCTCCTACGCCATCTTCTTCATCTCCCTCATTGTTCTCAGCTGTTGTGGGGACTTCCGGCG  587

Query  666  AAAGCACCCCTGGAACCTTGTTGCACTGTCGGTCCTGACCGCCAGCCTGTCGTACATGGTGGGGATGATCGCCA  739
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||.||||.||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  588  AAAGCATCCCTGGAACCTTGTTGCTCTGTCGATCCTGACCGTCAGCTTGTCCTACATGGTGGGCATGATAGCCA  661

Query  740  GCTTCTACAACACCGAGGCAGTCATCATGGCCGTGGGCATCACCACAGCCGTCTGCTTCACCGTCGTCATCTTC  813
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  662  GCTTTTACAACACGGAGGCAGTCATCATGGCCGTGGGCATCACCACAGCTGTCTGCTTCACGGTGGTCATCTTC  735

Query  814  TCCATGCAGACCCGCTACGACTTCACCTCATGCATGGGCGTGCTCCTGGTGAGCATGGTGGTGCTCTTCATCTT  887
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct  736  TCCATGCAGACCCGCTATGACTTCACCTCGTGCATGGGCGTGCTCCTGGTGAGTGTTGTGGTGCTCTTCATCTT  809

Query  888  CGCCATTCTCTGCATCTTCATCCGGAACCGCATCCTGGAGATCGTGTACGCCTCACTGGGCGCTCTGCTCTTCA  961
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  810  CGCCATCCTCTGCATCTTCATCCGGAACCGCATCCTGGAGATTGTATACGCCTCGCTGGGCGCTCTGCTCTTCA  883

Query  962  CCTGCTTCCTCGCAGTGGACACCCAGCTGCTGCTGGGGAACAAGCAGCTGTCCCTGAGCCCAGAAGAGTATGTG  1035
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  884  CCTGCTTCCTGGCAGTGGACACCCAGCTACTCCTGGGGAACAAGCAGCTGTCCCTGAGCCCAGAAGAATATGTG  957

Query 1036  TTTGCTGCGCTGAACCTGTACACAGACATCATCAACATCTTCCTGTACATCCTCACCATCATTGGCCGCGCCAA  1109
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  958  TTTGCGGCCCTGAACCTGTACACGGACATCATCAACATCTTCCTATATATTCTCACCATCATTGGCCGTGCCAA  1031

Query 1110  GGAG  1113
            ||||
Sbjct 1032  GGAG  1035