Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_00702
Subject:
NM_000561.4
Aligned Length:
654
Identities:
543
Gaps:
111

Alignment

Query   1  ATGCCCATGATACTGGGGTACTGGGACATCCGCGGGCTGGCCCACGCCATCCGCCTGCTCCTGGAATACACAGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCCATGATACTGGGGTACTGGGACATCCGCGGGCTGGCCCACGCCATCCGCCTGCTCCTGGAATACACAGA  74

Query  75  CTCAAGCTATGAGGAAAAGAAGTACACGATGGGGGACGCTCCTGATTATGACAGAAGCCAGTGGCTGAATGAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CTCAAGCTATGAGGAAAAGAAGTACACGATGGGGGACGCTCCTGATTATGACAGAAGCCAGTGGCTGAATGAAA  148

Query 149  AATTCAAGCTGGGCCTGGACTTTCCCAATCTGCCCTACTTGATTGATGGGGCTCACAAGATCACCCAGAGCAAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AATTCAAGCTGGGCCTGGACTTTCCCAATCTGCCCTACTTGATTGATGGGGCTCACAAGATCACCCAGAGCAAC  222

Query 223  GCCATCTTGTGCTACATTGCCCGCAAGCACAACCTGTGTGGGGAGACAGAAGAGGAGAAGATTCGTGTGGACAT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCCATCTTGTGCTACATTGCCCGCAAGCACAACCTGTGTGGGGAGACAGAAGAGGAGAAGATTCGTGTGGACAT  296

Query 297  TTTGGAGAACCAGACCATGGACAACCATATGCAGCTGGGCATGATCTGCTACAATCCAGAATTTGAGAAACTGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TTTGGAGAACCAGACCATGGACAACCATATGCAGCTGGGCATGATCTGCTACAATCCAGAATTTGAGAAACTGA  370

Query 371  AGCCAAAGTACTTGGAGGAACTCCCTGAAAAGCTAAAGCTCTACTCAGAGTTTCTGGGGAAGCGGCCATGGTTT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGCCAAAGTACTTGGAGGAACTCCCTGAAAAGCTAAAGCTCTACTCAGAGTTTCTGGGGAAGCGGCCATGGTTT  444

Query 445  GCAGGAAACA----------------------------------------------------------------  454
           ||||||||||                                                                
Sbjct 445  GCAGGAAACAAGATCACTTTTGTAGATTTTCTCGTCTATGATGTCCTTGACCTCCACCGTATATTTGAGCCCAA  518

Query 455  -----------------------------------------------AGGGCTTGGAGAAGATCTCTGCCTACA  481
                                                          |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GTGCTTGGACGCCTTCCCAAATCTGAAGGACTTCATCTCCCGCTTTGAGGGCTTGGAGAAGATCTCTGCCTACA  592

Query 482  TGAAGTCCAGCCGCTTCCTCCCAAGACCTGTGTTCTCAAAGATGGCTGTCTGGGGCAACAAG  543
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGAAGTCCAGCCGCTTCCTCCCAAGACCTGTGTTCTCAAAGATGGCTGTCTGGGGCAACAAG  654