Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00735
• Subject: NM_002113.2
• Aligned Length: 991
• Identities: 750
• Gaps: 182

Alignment

Query   1  ATGTGGCTCCTGGTCAGTGTAATTCTAATCTCACGGATATCCTCTGTTGGGGGAGAAGCAATGTTCTGTGATTT  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||
Sbjct   1  ATGTGGCTCCTGGTCAGTGTAATTCTAATCTCACGGATATCCTCTGTTGGGGGAGAAGCAACATTTTGTGATTT  74

Query  75  TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAAGTTCCTACAGGGGAAG  148
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCAAAAATAAACCATGGAATTCTATATGATGAAGAAAAATATAAGCCATTTTCCCAGGTTCCTACAGGGGAAG  148

Query 149  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGACTCGCATAACGTGCGCAGAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 149  TTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCATTTTGGACTCGCATAACATGCACAGAA  222

Query 223  GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GAAGGATGGTCACCAACACCAAAGTGTCTCAGACTGTGTTTCTTTCCTTTTGTGGAAAATGGTCATTCTGAATC  296

Query 297  TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG  370
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TTCAGGACAAACACATCTGGAAGGTGATACTGTGCAAATTATTTGCAACACAGGATACAGACTTCAAAACAATG  370

Query 371  AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCAAATGCAGGTCCACT---------------  429
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||               
Sbjct 371  AGAACAACATTTCATGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACCCCTCCCAAATGCAGGTCCACTGACACTTCCTGTGTG  444

Query 430  -AT-----------------------------------------------------------------------  431
            ||                                                                       
Sbjct 445  AATCCGCCCACAGTACAAAATGCTCATATACTGTCGAGACAGATGAGTAAATATCCATCTGGTGAGAGAGTACG  518

Query 432  --------------------------------------------------------------------------  431
                                                                                     
Sbjct 519  TTATGAATGTAGGAGCCCTTATGAAATGTTTGGGGATGAAGAAGTGATGTGTTTAAATGGAAACTGGACAGAAC  592

Query 432  ----------------TTCTGCAGAAAAATGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGAGACATTACTTCATTC  489
                           ||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593  CACCTCAATGCAAAGATTCTACGGGAAAATGTGGGCCCCCTCCACCTATTGACAATGGGGACATTACTTCATTC  666

Query 490  CTGTTGTCAGTATATGCTCCAGGTTCATCAGTTGAGTACCAGTGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAA  563
           |.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CCGTTGTCAGTATATGCTCCAGCTTCATCAGTTGAGTACCAATGCCAGAACTTGTATCAACTTGAGGGTAACAA  740

Query 564  TCAAATAACATGTAGAAACGGACAATGGTCAGAACCACCAAAATGCTTAGATCCATGTGTAATATCACAAGAAA  637
           .|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|.|||||
Sbjct 741  GCGAATAACATGTAGAAATGGACAATGGTCAGAACCACCAAAATGCTTACATCCGTGTGTAATATCCCGAGAAA  814

Query 638  TTATGGAAAAATATAACATAAAATTAAAGTGGACAAACCAACAAAAGCTTTATTCAAGAACAGGTGACAT-AGT  710
           ||||||||||.|||||||||..|||||.|||||||..|.||||.||||||||||..||||||||||| || ||.
Sbjct 815  TTATGGAAAATTATAACATAGCATTAAGGTGGACAGCCAAACAGAAGCTTTATTTGAGAACAGGTGA-ATCAGC  887

Query 711  TGAATTTGTTTGTAAATCTGGATATCATC---CAACAAAATCTCATTCATTTCGAGCAATGTGTCAGAATGGGA  781
           |||||||||.||||||...|||||||.||   ||.||...|||||..||||.|||.|||..|||..|.||||||
Sbjct 888  TGAATTTGTGTGTAAACGGGGATATCGTCTTTCATCACGTTCTCACACATTGCGAACAACATGTTGGGATGGGA  961

Query 782  AACTGGTATATCCCAGTTGTGAAGAAAAA  810
           ||||||..|||||.|.|||||.|.|||.|
Sbjct 962  AACTGGAGTATCCAACTTGTGCAAAAAGA  990