Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00763
• Subject: NM_000457.4
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1218
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACATGGCCGACTACAGTGCTGCACTGGACCCAGCCTACACCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACATGGCCGACTACAGTGCTGCACTGGACCCAGCCTACACCAC  74

Query   75  CCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAACCTCAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAACCTCAACG  148

Query  149  CGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACTACGGTGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACTACGGTGCC  222

Query  223  TCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGCAGATTTAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGCAGATTTAG  296

Query  297  CCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTTCCGGGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTTCCGGGCTG  370

Query  371  GCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGGACAGCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGGACAGCAGC  444

Query  445  CTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCCGGGATCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCCGGGATCAA  518

Query  519  CGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCTGCTGGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCTGCTGGTTC  592

Query  593  TCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGCTCAGAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGCTCAGAGCC  666

Query  667  CATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTCCTAGGCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTCCTAGGCAA  740

Query  741  TGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCTTGACGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCTTGACGAGC  814

Query  815  TGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCTTCTTTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCTTCTTTGAC  888

Query  889  CCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGCTTGGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGCTTGGAGGA  962

Query  963  CTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCACCTTGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCACCTTGCAGA  1036

Query 1037  GCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACAACCTGTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACAACCTGTTG  1110

Query 1111  CAGGAGATGCTGCTGGGA-GGTCC----GTG-------CCAAGCCCA------------------------GGA  1148
            |||||||||||||||||| |||||    |.|       |||.|||||                        |.|
Sbjct 1111  CAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCACCTGATGCA  1184

Query 1149  GGGGC----GGG-------------GTTG-----------------------------------------GAGT  1164
            ||..|    |||             ||||                                         ||||
Sbjct 1185  GGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGATGTGTGAGT  1258

Query 1165  GGGGACTCCCCAGGAGACAGGC--CTCACACAGTGAGCTCACCCCTCAGCTCCT----------TGGCTTCCCC  1226
            ||...|..||||||.|||||||  | ||| |..||||   |||||.|||| |||          |||||    |
Sbjct 1259  GGCCCCGACCCAGGGGACAGGCAGC-CAC-CCCTGAG---ACCCCACAGC-CCTCACCGCCAGGTGGCT----C  1322

Query 1227  A----CTGTGCCGCTTTGGGCAAGTTGCT---------------------------------------------  1251
            |    |||.||| ||.|    |||.|.||                                             
Sbjct 1323  AGGGTCTGAGCC-CTAT----AAGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCTGCCATCCC  1391

Query 1252  -------------------------------  1251
                                           
Sbjct 1392  CCAGCCGACCATCACCAAGCAGGAAGTTATC  1422