Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00768
- Subject:
- NM_001360495.1
- Aligned Length:
- 1394
- Identities:
- 1226
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ATGGAAACTGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCTAACACTGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA 74
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGACCGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCCAACACCGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGA 74
Query 75 AGATATGGAAGAGGAACAAGCATTTAAAAGATCTAGAAACACTGATGAGATGGTTGAATTACGCATTCTGCTTC 148
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 75 AGATATGGAAGAGGAGCAAGCCTTTAAAAGATCTAGAAATACTGATGAGATGGTTGAATTGCGCATTTTGCTTC 148
Query 149 AGAGCAAGAATGCTGGGGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC 222
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGCAAGAATGCTGGAGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACTACAATGCC 222
Query 223 AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATATTGAGTATCAGTGCTGATATTGAAACAATTGGAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 223 AGTGTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATACTGAGTATCAGTGCTGATATTGAGACGATTGGAGA 296
Query 297 AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAGGGCCTGCAGTTGCCATCACCCACTGCAACCAGCCAGCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATTCTGAAGAAAATCATCCCTACCTTGGAAGAG---------------------------------------- 330
Query 371 CGCTCGAATCTGATGCTGTGGAATGCTTAAATTACCAACACTATAAAGGAAGTGACTTTGACTGCGAGTTGAGG 444
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 331 --------------------------------TACCAACATTATAAAGGAAGTGACTTTGATTGCGAGTTGAGA 372
Query 445 CTGTTGATTCATCAGAGTCTAGCAGGAGGAATTATTGGGGTCAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAGAA 518
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 373 CTGTTGATTCATCAGAGTCTGGCAGGAGGAATAATTGGTGTTAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAAAA 446
Query 519 CACTCAAACCACCATCAAGCTTTTCCAGGAATGCTGTCCTCATTCCACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA 592
||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 CACTCAGACAACAATCAAGCTTTTCCAGGAGTGCTGCCCTCACTCTACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAA 520
Query 593 AACCCGATAGGGTTGTAGAGTGCATAAAGATCATCCTTGATCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA 666
||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 AACCTGATAGGGTTGTAGAATGCATCAAGATCATCCTTGACCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCA 594
Query 667 CAGCCTTATGATCCCAATTTTTACGATGAAACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGTCG 740
||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 595 CAACCTTATGATCCCAACTTTTATGATGAGACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGCCG 668
Query 741 CGGACGCCCAGTGGGATTTCCCATGCGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC 814
.|||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 AGGACGACCTGTGGGATTCCCCATGAGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTC 742
Query 815 CCATGCCTCCATCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCACCTCCCCCTCCTCCCGGACGA 888
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||
Sbjct 743 CCATGCCTCCTTCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGACCTCCACCACCACCACCTGGTCGA 816
Query 889 GGCGGCCGGGGTGGTAGCAGAGCTCGGAATCTTCCTCTTCCTCCACCACCACCACCTAGAGGGGGAGACCTCAT 962
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 817 GGTGGCCGGGGTGGCAGCAGAGCCCGGAATCTGCCTCTTCCTCCTCCACCACCACCCAGAGGGGGAGATCTAAT 890
Query 963 GGCCTATGACAGAAGAGGGAGACCTGGAGACCGTTACGACGGCATGGTTGGTTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG 1036
|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 GGCTTATGACAGAAGAGGAAGGCCTGGAGACCGCTATGATGGCATGGTTGGGTTCAGTGCTGATGAAACTTGGG 964
Query 1037 ACTCTGCAATAGATACATGGAGCCCATCAGAATGGCAGATGGCTTATGAACCACAGGGTGGCTCCGGATATGAT 1110
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 965 ATTCTGCAATTGACACATGGAGCCCATCAGAATGGCAAATGGCTTATGAACCACAGGGTGGTTCTGGATATGAC 1038
Query 1111 TATTCCTATGCAGGGGGTCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGTGGACCTATTATTACTACACAAGTAACTATTCC 1184
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 TATTCTTATGCAGGGGGCCGTGGCTCATATGGTGATCTTGGCGGACCTATTATCACTACACAAGTAACTATTCC 1112
Query 1185 CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATCCGTCATGAGTCGGGAGCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1113 CAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATTCGTCATGAATCTGGAGCAT 1186
Query 1259 CGATCAAAATTGATGAGCCTTTAGAAGGATCCGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA 1332
|.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CAATCAAAATTGATGAACCTTTAGAAGGATCTGAAGATCGGATCATTACCATTACAGGAACACAGGACCAGATA 1260
Query 1333 CAGAATGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTATGCAGATGTTGAAGGATTC-- 1392
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|.|||.|.||.
Sbjct 1261 CAGAACGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTAT-----TCTGGAAAGTTTTTC 1317