Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00800
• Subject: NM_002156.5
• Aligned Length: 1719
• Identities: 1719
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTTCGGTTACCCACAGTCTTTCGCCAGATGAGACCGGTGTCCAGGGTACTGGCTCCTCATCTCACTCGGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCGGTTACCCACAGTCTTTCGCCAGATGAGACCGGTGTCCAGGGTACTGGCTCCTCATCTCACTCGGGC  74

Query   75  TTATGCCAAAGATGTAAAATTTGGTGCAGATGCCCGAGCCTTAATGCTTCAAGGTGTAGACCTTTTAGCCGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTATGCCAAAGATGTAAAATTTGGTGCAGATGCCCGAGCCTTAATGCTTCAAGGTGTAGACCTTTTAGCCGATG  148

Query  149  CTGTGGCCGTTACAATGGGGCCAAAGGGAAGAACAGTGATTATTGAGCAGAGTTGGGGAAGTCCCAAAGTAACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGTGGCCGTTACAATGGGGCCAAAGGGAAGAACAGTGATTATTGAGCAGAGTTGGGGAAGTCCCAAAGTAACA  222

Query  223  AAAGATGGTGTGACTGTTGCAAAGTCAATTGACTTAAAAGATAAATACAAAAACATTGGAGCTAAACTTGTTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGATGGTGTGACTGTTGCAAAGTCAATTGACTTAAAAGATAAATACAAAAACATTGGAGCTAAACTTGTTCA  296

Query  297  AGATGTTGCCAATAACACAAATGAAGAAGCTGGGGATGGCACTACCACTGCTACTGTACTGGCACGCTCTATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGTTGCCAATAACACAAATGAAGAAGCTGGGGATGGCACTACCACTGCTACTGTACTGGCACGCTCTATAG  370

Query  371  CCAAGGAAGGCTTCGAGAAGATTAGCAAAGGTGCTAATCCAGTGGAAATCAGGAGAGGTGTGATGTTAGCTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGGAAGGCTTCGAGAAGATTAGCAAAGGTGCTAATCCAGTGGAAATCAGGAGAGGTGTGATGTTAGCTGTT  444

Query  445  GATGCTGTAATTGCTGAACTTAAAAAGCAGTCTAAACCTGTGACCACCCCTGAAGAAATTGCACAGGTTGCTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGCTGTAATTGCTGAACTTAAAAAGCAGTCTAAACCTGTGACCACCCCTGAAGAAATTGCACAGGTTGCTAC  518

Query  519  GATTTCTGCAAACGGAGACAAAGAAATTGGCAATATCATCTCTGATGCAATGAAAAAAGTTGGAAGAAAGGGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTTCTGCAAACGGAGACAAAGAAATTGGCAATATCATCTCTGATGCAATGAAAAAAGTTGGAAGAAAGGGTG  592

Query  593  TCATCACAGTAAAGGATGGAAAAACACTGAATGATGAATTAGAAATTATTGAAGGCATGAAGTTTGATCGAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATCACAGTAAAGGATGGAAAAACACTGAATGATGAATTAGAAATTATTGAAGGCATGAAGTTTGATCGAGGC  666

Query  667  TATATTTCTCCATACTTTATTAATACATCAAAAGGTCAGAAATGTGAATTCCAGGATGCCTATGTTCTGTTGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATATTTCTCCATACTTTATTAATACATCAAAAGGTCAGAAATGTGAATTCCAGGATGCCTATGTTCTGTTGAG  740

Query  741  TGAAAAGAAAATTTCTAGTATCCAGTCCATTGTACCTGCTCTTGAAATTGCCAATGCTCACCGTAAGCCTTTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAAAGAAAATTTCTAGTATCCAGTCCATTGTACCTGCTCTTGAAATTGCCAATGCTCACCGTAAGCCTTTGG  814

Query  815  TCATAATCGCTGAAGATGTTGATGGAGAAGCTCTAAGTACACTCGTCTTGAATAGGCTAAAGGTTGGTCTTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATAATCGCTGAAGATGTTGATGGAGAAGCTCTAAGTACACTCGTCTTGAATAGGCTAAAGGTTGGTCTTCAG  888

Query  889  GTTGTGGCAGTCAAGGCTCCAGGGTTTGGTGACAATAGAAAGAACCAGCTTAAAGATATGGCTATTGCTACTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTGTGGCAGTCAAGGCTCCAGGGTTTGGTGACAATAGAAAGAACCAGCTTAAAGATATGGCTATTGCTACTGG  962

Query  963  TGGTGCAGTGTTTGGAGAAGAGGGATTGACCCTGAATCTTGAAGACGTTCAGCCTCATGACTTAGGAAAAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGCAGTGTTTGGAGAAGAGGGATTGACCCTGAATCTTGAAGACGTTCAGCCTCATGACTTAGGAAAAGTTG  1036

Query 1037  GAGAGGTCATTGTGACCAAAGACGATGCCATGCTCTTAAAAGGAAAAGGTGACAAGGCTCAAATTGAAAAACGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAGGTCATTGTGACCAAAGACGATGCCATGCTCTTAAAAGGAAAAGGTGACAAGGCTCAAATTGAAAAACGT  1110

Query 1111  ATTCAAGAAATCATTGAGCAGTTAGATGTCACAACTAGTGAATATGAAAAGGAAAAACTGAATGAACGGCTTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTCAAGAAATCATTGAGCAGTTAGATGTCACAACTAGTGAATATGAAAAGGAAAAACTGAATGAACGGCTTGC  1184

Query 1185  AAAACTTTCAGATGGAGTGGCTGTGCTGAAGGTTGGTGGGACAAGTGATGTTGAAGTGAATGAAAAGAAAGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAAACTTTCAGATGGAGTGGCTGTGCTGAAGGTTGGTGGGACAAGTGATGTTGAAGTGAATGAAAAGAAAGACA  1258

Query 1259  GAGTTACAGATGCCCTTAATGCTACAAGAGCTGCTGTTGAAGAAGGCATTGTTTTGGGAGGGGGTTGTGCCCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTTACAGATGCCCTTAATGCTACAAGAGCTGCTGTTGAAGAAGGCATTGTTTTGGGAGGGGGTTGTGCCCTC  1332

Query 1333  CTTCGATGCATTCCAGCCTTGGACTCATTGACTCCAGCTAATGAAGATCAAAAAATTGGTATAGAAATTATTAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTCGATGCATTCCAGCCTTGGACTCATTGACTCCAGCTAATGAAGATCAAAAAATTGGTATAGAAATTATTAA  1406

Query 1407  AAGAACACTCAAAATTCCAGCAATGACCATTGCTAAGAATGCAGGTGTTGAAGGATCTTTGATAGTTGAGAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGAACACTCAAAATTCCAGCAATGACCATTGCTAAGAATGCAGGTGTTGAAGGATCTTTGATAGTTGAGAAAA  1480

Query 1481  TTATGCAAAGTTCCTCAGAAGTTGGTTATGATGCTATGGCTGGAGATTTTGTGAATATGGTGGAAAAAGGAATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTATGCAAAGTTCCTCAGAAGTTGGTTATGATGCTATGGCTGGAGATTTTGTGAATATGGTGGAAAAAGGAATC  1554

Query 1555  ATTGACCCAACAAAGGTTGTGAGAACTGCTTTATTGGATGCTGCTGGTGTGGCCTCTCTGTTAACTACAGCAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTGACCCAACAAAGGTTGTGAGAACTGCTTTATTGGATGCTGCTGGTGTGGCCTCTCTGTTAACTACAGCAGA  1628

Query 1629  AGTTGTAGTCACAGAAATTCCTAAAGAAGAGAAGGACCCTGGAATGGGTGCAATGGGTGGAATGGGAGGTGGTA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGTTGTAGTCACAGAAATTCCTAAAGAAGAGAAGGACCCTGGAATGGGTGCAATGGGTGGAATGGGAGGTGGTA  1702

Query 1703  TGGGAGGTGGCATGTTC  1719
            |||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGGAGGTGGCATGTTC  1719