Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00808
• Subject: NM_008315.2
• Aligned Length: 1345
• Identities: 1218
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGATGGACGTTAACAGCAGCGGCCGCCCGGACCTCTACGGGCACCTCCGCTCTTTCCTTCTGCCAGAAGTGGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.||.|.|||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGATGGACGTTAACAGCAGCGGCCGCCCCGACCTCTACGGCCATCTCCGCTCTCTCATCCTGCCGGAGGTGGG  74

Query   75  GCGCGGGCTGCCCGACTTGAGCCCCGACGGTGGCGCCGACCCGGTCGCGGGCTCCTGGGCGCCGCACCTGCTGA  148
            ||||.||||||..|||.||||||||||||||||||||.||.||||.|.|.||||||||..||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCAGGCTGCAGGACCTGAGCCCCGACGGTGGCGCCCACTCGGTGGTGAGCTCCTGGATGCCGCACCTGCTGA  148

Query  149  GC---------GAGGTGACAGCCAGCCCGGCGCCCACCTGGGACGCGCCCCCGGACAATGCCTCCGGCTGTGGG  213
            ||         |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  149  GCGGCTTCCCAGAGGTGACAGCTAGCCCGGCGCCCACCTGGGACGCGCCCCCGGACAATGTCTCCGGCTGCGGG  222

Query  214  GAACAGATCAACTACGGCAGAGTCGAGAAAGTTGTGATCGGCTCCATCCTGACGCTCATCACGCTGCTGACGAT  287
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCAGATCAACTATGGCAGAGTCGAGAAAGTTGTGATCGGCTCCATCCTGACGCTCATCACGCTGCTGACGAT  296

Query  288  CGCGGGCAACTGCCTGGTGGTGATCTCCGTGTGCTTCGTCAAGAAGCTCCGCCAGCCCTCCAACTACCTGATCG  361
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CGCGGGCAACTGCCTGGTGGTGATCTCGGTGTGCTTTGTCAAGAAGCTCCGCCAGCCCTCCAACTACCTGATTG  370

Query  362  TGTCCCTGGCGCTGGCCGACCTCTCGGTGGCTGTGGCGGTCATGCCCTTCGTCAGCGTCACCGACCTCATCGGG  435
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCCTGGCGCTGGCTGACCTCTCGGTGGCCGTGGCGGTCATGCCTTTCGTTAGTGTCACGGACCTCATCGGG  444

Query  436  GGCAAGTGGATCTTTGGACACTTTTTCTGTAATGTCTTCATCGCCATGGACGTCATGTGCTGCACGGCCTCGAT  509
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCAAGTGGATCTTCGGCCACTTCTTCTGCAACGTCTTCATCGCCATGGACGTCATGTGCTGCACGGCCTCGAT  518

Query  510  CATGACCCTGTGCGTGATCAGCATTGACAGGTACCTTGGGATCACAAGGCCCCTCACATACCCTGTGAGGCAGA  583
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  CATGACCCTGTGCGTGATCAGCATCGACAGGTACCTTGGGATCACCAGGCCCCTCACGTACCCCGTGAGGCAGA  592

Query  584  ATGGGAAATGCATGGCGAAGATGATTCTCTCCGTCTGGCTTCTCTCCGCCTCCATCACCTTACCTCCACTCTTT  657
            ||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  593  ATGGGAAATGTATGGCCAAAATGATTCTGTCGGTCTGGCTTCTCTCTGCCTCCATCACCTTACCTCCTCTCTTC  666

Query  658  GGATGGGCTCAGAATGTAAATGATGATAAGGTGTGCTTGATCAGCCAGGACTTTGGCTATACGATTTACTCTAC  731
            |||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  667  GGATGGGCTCAGAATGTGAACGATGACAAAGTGTGCTTGATCAGCCAGGATTTTGGCTACACGATCTACTCCAC  740

Query  732  CGCAGTGGCATTTTATATCCCCATGTCCGTCATGCTTTTCATGTACTACCAGATTTACAAGGCTGCCAGGAAGA  805
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CGCAGTGGCGTTTTATATCCCCATGTCGGTCATGCTGTTCATGTACTATCAGATTTACAAGGCCGCCAGGAAGA  814

Query  806  GTGCTGCCAAACACAAGTTTCCTGGCTTCCCTCGAGTGGAGCCAGACAGCGTCATCGCCCTGAATGGCATAGTG  879
            |.||.||||||||||||||..|.||||||||.||.|||.||||.||.|||||||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct  815  GCGCAGCCAAACACAAGTTCTCAGGCTTCCCACGCGTGCAGCCGGAGAGCGTCATCTCCCTGAATGGCGTGGTG  888

Query  880  AAGCTCCAGAAGGAGGTGGAAGAGTGTGCAAACCTTTCGAGACTCCTCAAGCATGAAAGGAAAAACATCTCCAT  953
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  AAACTCCAGAAGGAGGTGGAAGAGTGTGCGAACCTTTCGAGACTGCTCAAACACGAAAGGAAAAACATTTCCAT  962

Query  954  CTTTAAGCGAGAACAGAAAGCAGCCACCACCCTGGGGATCATCGTCGGGGCCTTTACCGTGTGCTGGCTGCCAT  1027
            |||.|||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  CTTCAAGAGGGAACAGAAAGCAGCCACTACCTTGGGGATCATCGTGGGAGCCTTCACGGTGTGCTGGCTGCCGT  1036

Query 1028  TTTTCCTCCTCTCGACAGCCAGACCCTTCATCTGTGGCACTTCCTGCAGCTGCATCCCACTGTGGGTGGAGAGG  1101
            ||||||||.|.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTTCCTCTTGTCCACAGCAAGGCCCTTTATCTGTGGCACCTCCTGTAGCTGCATCCCGCTGTGGGTGGAGAGG  1110

Query 1102  ACATTTCTGTGGCTAGGCTATGCAAACTCTCTCATTAACCCTTTTATATATGCCTTCTTCAACCGGGACCTGAG  1175
            ||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACATGTCTGTGGCTGGGCTATGCAAACTCTCTCATTAACCCTTTTATATATGCCTTCTTCAACCGGGACCTGAG  1184

Query 1176  GACCACCTATCGCAGCCTGCTCCAGTGCCAGTACCGGAATATCAACCGGAAGCTCTCAGCTGCAGGCATGCATG  1249
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GACCACCTATCGTAGCCTACTCCAGTGCCAGTACCGGAATATCAACCGGAAGCTCTCTGCTGCAGGCATGCACG  1258

Query 1250  AAGCCCTGAAGCTTGCTGAGAGGCCAGAGAGACCTGAGTTTGTGCTACAAAA-TGCTGACTACTGTAGAAAAAA  1322
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||...||||||||||||||||| || ||||.|||||.|.|||||
Sbjct 1259  AAGCCCTGAAACTTGCTGAGAGGCCTGAGAGAAGCGAGTTTGTGCTACAAAACTG-TGACCACTGTGGGAAAAA  1331

Query 1323  AGGTCATGATTCA  1335
            ||||||||||.||
Sbjct 1332  AGGTCATGATACA  1344