Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00808
- Subject:
- NM_019860.4
- Aligned Length:
- 1335
- Identities:
- 1295
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGATGGACGTTAACAGCAGCGGCCGCCCGGACCTCTACGGGCACCTCCGCTCTTTCCTTCTGCCAGAAGTGGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGACGTTAACAGCAGCGGCCGCCCGGACCTCTACGGGCACCTCCGCTCTTTCCTTCTGCCAGAAGTGGG 74
Query 75 GCGCGGGCTGCCCGACTTGAGCCCCGACGGTGGCGCCGACCCGGTCGCGGGCTCCTGGGCGCCGCACCTGCTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGCGGGCTGCCCGACTTGAGCCCCGACGGTGGCGCCGACCCGGTCGCGGGCTCCTGGGCGCCGCACCTGCTGA 148
Query 149 GCGAGGTGACAGCCAGCCCGGCGCCCACCTGGGACGCGCCCCCGGACAATGCCTCCGGCTGTGGGGAACAGATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGAGGTGACAGCCAGCCCGGCGCCCACCTGGGACGCGCCCCCGGACAATGCCTCCGGCTGTGGGGAACAGATC 222
Query 223 AACTACGGCAGAGTCGAGAAAGTTGTGATCGGCTCCATCCTGACGCTCATCACGCTGCTGACGATCGCGGGCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTACGGCAGAGTCGAGAAAGTTGTGATCGGCTCCATCCTGACGCTCATCACGCTGCTGACGATCGCGGGCAA 296
Query 297 CTGCCTGGTGGTGATCTCCGTGTGCTTCGTCAAGAAGCTCCGCCAGCCCTCCAACTACCTGATCGTGTCCCTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGCCTGGTGGTGATCTCCGTGTGCTTCGTCAAGAAGCTCCGCCAGCCCTCCAACTACCTGATCGTGTCCCTGG 370
Query 371 CGCTGGCCGACCTCTCGGTGGCTGTGGCGGTCATGCCCTTCGTCAGCGTCACCGACCTCATCGGGGGCAAGTGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGCTGGCCGACCTCTCGGTGGCTGTGGCGGTCATGCCCTTCGTCAGCGTCACCGACCTCATCGGGGGCAAGTGG 444
Query 445 ATCTTTGGACACTTTTTCTGTAATGTCTTCATCGCCATGGACGTCATGTGCTGCACGGCCTCGATCATGACCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCTTTGGACACTTTTTCTGTAATGTCTTCATCGCCATGGACGTCATGTGCTGCACGGCCTCGATCATGACCCT 518
Query 519 GTGCGTGATCAGCATTGACAGGTACCTTGGGATCACAAGGCCCCTCACATACCCTGTGAGGCAGAATGGGAAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGCGTGATCAGCATTGACAGGTACCTTGGGATCACAAGGCCCCTCACATACCCTGTGAGGCAGAATGGGAAAT 592
Query 593 GCATGGCGAAGATGATTCTCTCCGTCTGGCTTCTCTCCGCCTCCATCACCTTACCTCCACTCTTTGGATGGGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCATGGCGAAGATGATTCTCTCCGTCTGGCTTCTCTCCGCCTCCATCACCTTACCTCCACTCTTTGGATGGGCT 666
Query 667 CAGAATGTAAATGATGATAAGGTGTGCTTGATCAGCCAGGACTTTGGCTATACGATTTACTCTACCGCAGTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGAATGTAAATGATGATAAGGTGTGCTTGATCAGCCAGGACTTTGGCTATACGATTTACTCTACCGCAGTGGC 740
Query 741 ATTTTATATCCCCATGTCCGTCATGCTTTTCATGTACTACCAGATTTACAAGGCTGCCAGGAAGAGTGCTGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTTTATATCCCCATGTCCGTCATGCTTTTCATGTACTACCAGATTTACAAGGCTGCCAGGAAGAGTGCTGCCA 814
Query 815 AACACAAGTTTCCTGGCTTCCCTCGAGTGGAGCCAGACAGCGTCATCGCCCTGAATGGCATAGTGAAGCTCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACACAAGTTTCCTGGCTTCCCTCGAGTGGAGCCAGACAGCGTCATCGCCCTGAATGGCATAGTGAAGCTCCAG 888
Query 889 AAGGAGGTGGAAGAGTGTGCAAACCTTTCGAGACTCCTCAAGCATGAAAGGAAAAACATCTCCATCTTTAAGCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGGAGGTGGAAGAGTGTGCAAACCTTTCGAGACTCCTCAAGCATGAAAGGAAAAACATCTCCATCTTTAAGCG 962
Query 963 AGAACAGAAAGCAGCCACCACCCTGGGGATCATCGTCGGGGCCTTTACCGTGTGCTGGCTGCCATTTTTCCTCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAACAGAAAGCAGCCACCACCCTGGGGATCATCGTCGGGGCCTTTACCGTGTGCTGGCTGCCATTTTTCCTCC 1036
Query 1037 TCTCGACAGCCAGACCCTTCATCTGTGGCACTTCCTGCAGCTGCATCCCACTGTGGGTGGAGAGGACATTTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTCGACAGCCAGACCCTTCATCTGTGGCACTTCCTGCAGCTGCATCCCACTGTGGGTGGAGAGGACATTTCTG 1110
Query 1111 TGGCTAGGCTATGCAAACTCTCTCATTAACCCTTTTATATATGCCTTCTTCAACCGGGACCTGAGGACCACCTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGGCTAGGCTATGCAAACTCTCTCATTAACCCTTTTATATATGCCTTCTTCAACCGGGACCTGAGGACCACCTA 1184
Query 1185 TCGCAGCCTGCTCCAGTGCCAGTACCGGAATATCAACCGGAAGCTCTCAGCTGCAGGCATGCATGAAGCCCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCGCAGCCTGCTCCAGTGCCAGTACCGGAATATCAACCGGAAGCTCTCAGCTGCAGGCATGCATGAAGCCCTGA 1258
Query 1259 AGCTTGCTGAGAGGCCAGAGAGACCTGAGTTTGTGCTACAAAATGCTGACTACTGTAGAAAAAAAGGTCATGAT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259 AGCTTGCTGAGAGGCCAGAGAGACCTGAGTTTGTGCTG------------------------------------ 1296
Query 1333 TCA 1335
Sbjct 1297 --- 1296