Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00817
• Subject: NM_001290114.2
• Aligned Length: 1356
• Identities: 966
• Gaps: 390

Alignment

Query    1  ATGGCCGGCTACCTGCGGGTCGTGCGCTCGCTCTGCAGAGCCTCAGGCTCGCGGCCGGCCTGGGCGCCGGCGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGACAGCCCCCACCTCGCAAGAGCAGCCGCGGCGCCACTATGCCGACAAAAGGATCAAGGTGGCGAAGCCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGGAGATGGATGGTGATGAGATGACCCGTATTATCTGGCAGTTCATCAAGGAGAAGCTCATCCTGCCCCAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTGGACATCCAGCTAAAGTATTTTGACCTCGGGCTCCCAAACCGTGACCAGACTGATGACCAGGTCACCATTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTCTGCACTGGCCACCCAGAAGTACAGTGTGGCTGTCAAGTGTGCCACCATCACCCCTGATGAGGCCCGTGTGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AAGAGTTCAAGCTGAAGAAGATGTGGAAAAGTCCCAATGGAACTATCCGGAACATCCTGGGGGGGACTGTCTTC  444
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGTGGAAAAGTCCCAATGGAACTATCCGGAACATCCTGGGGGGGACTGTCTTC  54

Query  445  CGGGAGCCCATCATCTGCAAAAACATCCCACGCCTAGTCCCTGGCTGGACCAAGCCCATCACCATTGGCAGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  CGGGAGCCCATCATCTGCAAAAACATCCCACGCCTAGTCCCTGGCTGGACCAAGCCCATCACCATTGGCAGGCA  128

Query  519  CGCCCATGGCGACCAGTACAAGGCCACAGACTTTGTGGCAGACCGGGCCGGCACTTTCAAAATGGTCTTCACCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  CGCCCATGGCGACCAGTACAAGGCCACAGACTTTGTGGCAGACCGGGCCGGCACTTTCAAAATGGTCTTCACCC  202

Query  593  CAAAAGATGGCAGTGGTGTCAAGGAGTGGGAAGTGTACAACTTCCCCGCAGGCGGCGTGGGCATGGGCATGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  CAAAAGATGGCAGTGGTGTCAAGGAGTGGGAAGTGTACAACTTCCCCGCAGGCGGCGTGGGCATGGGCATGTAC  276

Query  667  AACACCGACGAGTCCATCTCAGGTTTTGCGCACAGCTGCTTCCAGTATGCCATCCAGAAGAAATGGCCGCTGTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  AACACCGACGAGTCCATCTCAGGTTTTGCGCACAGCTGCTTCCAGTATGCCATCCAGAAGAAATGGCCGCTGTA  350

Query  741  CATGAGCACCAAGAACACCATACTGAAAGCCTACGATGGGCGTTTCAAGGACATCTTCCAGGAGATCTTTGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  CATGAGCACCAAGAACACCATACTGAAAGCCTACGATGGGCGTTTCAAGGACATCTTCCAGGAGATCTTTGACA  424

Query  815  AGCACTATAAGACCGACTTCGACAAGAATAAGATCTGGTATGAGCACCGGCTCATTGATGACATGGTGGCTCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  AGCACTATAAGACCGACTTCGACAAGAATAAGATCTGGTATGAGCACCGGCTCATTGATGACATGGTGGCTCAG  498

Query  889  GTCCTCAAGTCTTCGGGTGGCTTTGTGTGGGCCTGCAAGAACTATGACGGAGATGTGCAGTCAGACATCCTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  GTCCTCAAGTCTTCGGGTGGCTTTGTGTGGGCCTGCAAGAACTATGACGGAGATGTGCAGTCAGACATCCTGGC  572

Query  963  CCAGGGCTTTGGCTCCCTTGGCCTGATGACGTCCGTCCTGGTCTGCCCTGATGGGAAGACGATTGAGGCTGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  CCAGGGCTTTGGCTCCCTTGGCCTGATGACGTCCGTCCTGGTCTGCCCTGATGGGAAGACGATTGAGGCTGAGG  646

Query 1037  CCGCTCATGGGACCGTCACCCGCCACTATCGGGAGCACCAGAAGGGCCGGCCCACCAGCACCAACCCCATCGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  CCGCTCATGGGACCGTCACCCGCCACTATCGGGAGCACCAGAAGGGCCGGCCCACCAGCACCAACCCCATCGCC  720

Query 1111  AGCATCTTTGCCTGGACACGTGGCCTGGAGCACCGGGGGAAGCTGGATGGGAACCAAGACCTCATCAGGTTTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AGCATCTTTGCCTGGACACGTGGCCTGGAGCACCGGGGGAAGCTGGATGGGAACCAAGACCTCATCAGGTTTGC  794

Query 1185  CCAGATGCTGGAGAAGGTGTGCGTGGAGACGGTGGAGAGTGGAGCCATGACCAAGGACCTGGCGGGCTGCATTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  CCAGATGCTGGAGAAGGTGTGCGTGGAGACGGTGGAGAGTGGAGCCATGACCAAGGACCTGGCGGGCTGCATTC  868

Query 1259  ACGGCCTCAGCAATGTGAAGCTGAACGAGCACTTCCTGAACACCACGGACTTCCTCGACACCATCAAGAGCAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  ACGGCCTCAGCAATGTGAAGCTGAACGAGCACTTCCTGAACACCACGGACTTCCTCGACACCATCAAGAGCAAC  942

Query 1333  CTGGACAGAGCCCTGGGCAGGCAG  1356
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  CTGGACAGAGCCCTGGGCAGGCAG  966