Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00880
- Subject:
- XM_017312580.1
- Aligned Length:
- 1111
- Identities:
- 931
- Gaps:
- 65
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATGCCGGTGGA 11
|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGGGAACTGAATATACTCAACTCCTGCCTAGGAAGAGGCTGCTGGGAAAAGGGTACCATGCCGGTGGA 74
Query 12 AAGGATGCGCATGCGCCCGTGGCTGGAGGAGCAGATAAACTCCAACACGATCCCGGGGCTCAAGTGGCTTAACA 85
|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 75 ACGGATGCGAATGCGCCCGTGGCTGGAGGAGCAGATAAATTCCAATACGATACCAGGGCTAAAGTGGCTGAACA 148
Query 86 AGGAAAAGAAGATTTTTCAGATCCCCTGGATGCATGCGGCTAGACATGGGTGGGATGTGGAAAAAGATGCACCA 159
||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 149 AGGAGAAGAAGATTTTCCAGATCCCCTGGATGCATGCGGCTCGGCACGGATGGGACGTGGAAAAGGATGCTCCG 222
Query 160 CTCTTTAGAAACTGGGCAATCCATACAGGAAAGCATCAACCAGGAGTAGATAAACCTGATCCCAAAACATGGAA 233
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223 CTCTTCAGAAACTGGGCGATCCATACAGGAAAGCATCAACCAGGAATAGATAAACCAGATCCAAAAACATGGAA 296
Query 234 GGCGAATTTCAGATGCGCCATGAATTCCTTGCCTGATATTGAAGAAGTCAAGGATAAAAGCATAAAGAAAGGAA 307
.||.|||||..||||.||||||||||||.||||.||.|||||.|||||.|||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 297 AGCAAATTTTCGATGTGCCATGAATTCCCTGCCCGACATTGAGGAAGTGAAGGACAGAAGCATAAAGAAAGGAA 370
Query 308 ATAATGCCTTCAGGGTCTACCGAATGCTGCCCCTATCAGAACGGCCTTCTAAGAAAGGAAAGAAACCAAAGACA 381
|.||.||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAACGCCTTCAGAGTCTACCGGATGCTGCCCTTATCCGAACGACCTTCCAAGAAAGGAAAGAAACCAAAGACA 444
Query 382 GAAAAAGAAGACAAAGTTAAGCACATCAAGCAAGAACCAGTTGAGTCATCTCTGGGGCTTAGTAATGGAGTAAG 455
|||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAAAAGAAGAGAGAGTTAAGCACATCAAGCAAGAACCAGTTGAGTCATCTTTGGGGCTTAGTAATGGAGTAAG 518
Query 456 TGATCTTTCTCCTGAGTATGCGGTCCTGACTTCAACTATAAAAAATGAAGTGGATAGTACGGTGAACATCATAG 529
||...|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGCTTTTCTCCTGAGTATGCGGTCCTGACTTCAGCTATAAAAAATGAAGTGGATAGTACGGTGAACATCATAG 592
Query 530 TTGTAGGACAGTCCCATCTGGACAGCAACATTGAGAATCAAGAGATTGTCACCAATCCGCCAGACATTTGCCAA 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 593 TTGTAGGACAGTCCCATCTGGACAGCAACATTGAAGATCAAGAGATCGTCACTAACCCGCCAGACATCTGCCAG 666
Query 604 GTTGTAGAGGTGACCACTGAGAGCGACGAGCAGCCGGTCAGCATGAGCGAGCTCTACCCTCTGCAGATCTCCCC 677
||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 667 GTTGTAGAAGTGACCACTGAGAGTGATGACCAGCCAGTCAGCATGAGTGAGCTCTACCCTCTACAGATTTCTCC 740
Query 678 CGTGTCTTCCTATGCAGAAAGCGAAACGACTGATAGTGTGCCCAGCGATGAAGAGAGTGCCGAGGGGCGGCCAC 751
.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||..||.||||||.|.||||
Sbjct 741 TGTGTCTTCCTACGCAGAAAGCGAAACTACCGACAGTGTGGCCAGTGATGAAGAGAACGCAGAGGGGAGACCAC 814
Query 752 ACTGGCGGAAGAGGAATATTGAAGGCAAACAGTACCTCAGCAACATGGGGACTCGAGGCTCCTACCTGCTGCCC 825
|||||.|||||||||..||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||...|.||||.|||||||||
Sbjct 815 ACTGGAGGAAGAGGAGCATCGAAGGCAAGCAGTACCTCAGCAACATGGGGACACGGAACACCTATCTGCTGCCC 888
Query 826 GGCATGGCGTCCTTCGTCACTTCCAACAAACCGGACCTCCAGGTCACCATCAAAGAGGAGAGCAATCCGGTGCC 899
.||||||||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||..||||.||||
Sbjct 889 AGCATGGCGACCTTTGTCACCTCCAACAAGCCAGATCTGCAGGTCACCATCAAAGAGGATAGCTGTCCGATGCC 962
Query 900 TTACAACAGCTCCTGGCCCCCTTTTCAAGACCTCCCCCTTTCTTCCTCCA-TGACCCCAGCATCCAGCAGCAGT 972
|||||||||||||||||||||.|||..||||||.||||||.||.|| ||| |||||||..|..|||||||||||
Sbjct 963 TTACAACAGCTCCTGGCCCCCATTTACAGACCTTCCCCTTCCTGCC-CCAGTGACCCCCACGCCCAGCAGCAGT 1035
Query 973 CGGCCAGACCGGGAGACCCGGGCCAGCGTCATCAAGAAAACATCGGATATCACCCAGGCCCGCGTCAAGAGCTG 1046
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036 CGGCCAGACCGGGAGACCCGGGCCAGTGTCATCAAGAAGACATCTGATATCACCCAGGCCCGTGTCAAGAGCTG 1109
Query 1047 T 1047
|
Sbjct 1110 T 1110