Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00894
• Subject: NM_001168354.1
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1026
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGAATGCTTCCAG-TCGGA-----ATGTGTTTGACA---CGTTGATCAGGGTGTTGACAGAAAGTATGTTCAA  65
            |||.|||||| ||| |||||     |||||     ||   .|.|||||||||...||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGCTT-CAGATCGGAGGTGTATGTG-----CAGAGTGCTGATCAGGGCACTGACAGAAAGGATGTTCAA  68

Query   66  ACATCTTCGGAAATGGGTCGTCACTCGCTTTTTTGGGCATTCTCGGCAAAGAGCAAGGCTAGTCTCCAAAGATG  139
            |||||||||.|.||||.|.|||||||.|.|.|||||||.||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct   69  ACATCTTCGAAGATGGTTTGTCACTCACATATTTGGGCGTTCTCGGCAACGAGCAAGGTTGGTCTCCAAAGATG  142

Query  140  GAAGGTGCAACATAGAATTTGGCAATGTGGAGGCACAGTCAAGGTTTATATTCTTTGTGGACATCTGGACAACG  213
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  143  GAAGGTGTAACATCGAGTTTGGCAATGTAGATGCACAGTCGAGGTTTATATTCTTTGTGGATATCTGGACAACT  216

Query  214  GTACTTGACCTCAAGTGGAGATACAAAATGACCATTTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTTTCTTTGG  287
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  217  GTACTTGACCTGAAATGGAGGTACAAAATGACCGTGTTCATCACAGCCTTCTTGGGGAGTTGGTTTCTCTTTGG  290

Query  288  TCTCCTGTGGTATGCAGTAGCGTACATTCACAAAGACCTCCCGGAATTCCATCCTTCTGCCAATCACACTCCCT  361
            ||||||||||||||..|||||.||..||||.||.||.|||||.||.|||.|.||..|||.|||.|..|||||.|
Sbjct  291  TCTCCTGTGGTATGTCGTAGCCTATGTTCATAAGGATCTCCCAGAGTTCTACCCACCTGACAACCGTACTCCTT  364

Query  362  GTGTGGAGAATATTAATGGCTTGACCTCAGCTTTTCTGTTTTCTCTGGAGACTCAAGTGACCATTGGATATGGA  435
            ||||||||||.|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct  365  GTGTGGAGAACATTAATGGCATGACATCAGCCTTTCTGTTTTCTCTAGAGACCCAAGTGACCATAGGTTACGGA  438

Query  436  TTCAGGTGTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTTCAGTCTATACTTGGAGTTATAAT  509
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  439  TTCAGGTTTGTGACAGAACAGTGTGCCACTGCCATTTTTCTGCTTATCTTCCAGTCTATTCTTGGAGTGATCAT  512

Query  510  CAATTCTTTCATGTGTGGGGCCATCTTAGCCAAGATCTCCAGGCCCAAAAAACGTGCCAAGACCATTACGTTCA  583
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  513  CAATTCTTTCATGTGTGGTGCCATATTAGCCAAGATCTCTAGACCCAAAAAACGTGCAAAGACCATTACATTCA  586

Query  584  GCAAGAACGCAGTGATCAGCAAACGGGGAGGGAAGCTTTGCCTCCTAATCCGAGTGGCTAATCTCAGGAAGAGC  657
            |||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  587  GCAAGAATGCGGTGATCAGCAAACGTGGGGGGAAGCTCTGTCTCCTCATCCGAGTAGCAAATCTTAGGAAAAGC  660

Query  658  CTTCTTATTGGCAGTCACATTTATGGAAAGCTTCTGAAGACCACAGTCACTCCTGAAGGAGAGACCATTATTTT  731
            |||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CTTCTGATTGGCAGTCACATATATGGTAAGCTTCTGAAGACTACCATCACACCTGAAGGAGAGACCATTATTTT  734

Query  732  GGACCAGATCAATATCAACTTTGTAGTTGACGCTGGGAATGAAAATTTATTCTTCATCTCCCCATTGACAATTT  805
            |||.||||.||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.|
Sbjct  735  GGATCAGACCAATATAAACTTTGTAGTTGATGCTGGCAATGAAAATTTGTTCTTCATTTCCCCACTGACAATCT  808

Query  806  ACCATGTCATTGATCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCAGCGGAGACCCTTCTCCAGCAGGACTTTGAATTA  879
            ||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||..|||.||||||||.||.||.
Sbjct  809  ACCACATTATTGACCACAACAGCCCTTTCTTCCACATGGCGGCAGAAACTCTTTCCCAACAGGACTTCGAGTTG  882

Query  880  GTGGTGTTTTTAGATGGCACAGTGGAGTCCACCAGTGCTACCTGCCAAGTCCGGACATCCTATGTCCCAGAGGA  953
            ||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..|||||||.||
Sbjct  883  GTTGTCTTTTTAGATGGCACAGTAGAATCCACCAGTGCAACCTGCCAAGTCCGCACATCATACATCCCAGAAGA  956

Query  954  GGTGCTTTGGGGCTACCGTTTTGCTCCCATAGTATCCAAGACAAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATA  1027
            ||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GGTGCTTTGGGGTTACCGTTTTGTTCCCATCGTATCCAAGACCAAGGAAGGGAAATACCGAGTGGATTTCCATA  1030

Query 1028  ACTTTAGCAAGACAGTGGAAGTGGAGACCCCTCACTGTGCCATGTGCCTTTATAATGAGAAAGATGTTAGAGCC  1101
            |||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||..||.|||
Sbjct 1031  ACTTTGGTAAGACGGTGGAAGTGGAGACCCCTCATTGTGCCATGTGCCTCTATAATGAGAAAGATGCCAGGGCC  1104

Query 1102  AGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCCAACTTCATCTTGTCAGAAGTCAATGAAACAGATGACACCAAAATG  1173
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||..||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1105  AGGATGAAGAGAGGCTATGACAACCCTAACTTTGTCTTGTCAGAAGTTGATGAAACAGACGACACCCAAATG  1176