Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00961
• Subject: XM_017025746.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1311
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGTCGTCCATCTTGCCATTCACGCCGCCAGTTGTGAAGAGACTGCTGGGATGGAAGAAGTCAGCTGGTGGGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGTCCATCTTGCCATTCACGCCGCCAGTTGTGAAGAGACTGCTGGGATGGAAGAAGTCAGCTGGTGGGTC  74

Query   75  TGGAGGAGCAGGCGGAGGAGAGCAGAATGGGCAGGAAGAAAAGTGGTGTGAGAAAGCAGTGAAAAGTCTGGTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGAGGAGCAGGCGGAGGAGAGCAGAATGGGCAGGAAGAAAAGTGGTGTGAGAAAGCAGTGAAAAGTCTGGTGA  148

Query  149  AGAAGCTAAAGAAAACAGGACGATTAGATGAGCTTGAGAAAGCCATCACCACTCAAAACTGTAATACTAAATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAGCTAAAGAAAACAGGACGATTAGATGAGCTTGAGAAAGCCATCACCACTCAAAACTGTAATACTAAATGT  222

Query  223  GTTACCATACCAAGCACTTGCTCTGAAATTTGGGGACTGAGTACACCAAATACGATAGATCAGTGGGATACAAC  296
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  223  GTTACCATACCA--------------------------------------------------------------  234

Query  297  AGGCCTTTACAGCTTCTCTGAACAAACCAGGTCTCTTGATGGTCGTCTCCAGGTATCCCATCGAAAAGGATTGC  370
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  ----------------------------AGGTCTCTTGATGGTCGTCTCCAGGTATCCCATCGAAAAGGATTGC  280

Query  371  CACATGTTATATATTGCCGATTATGGCGCTGGCCTGATCTTCACAGTCATCATGAACTCAAGGCAATTGAAAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CACATGTTATATATTGCCGATTATGGCGCTGGCCTGATCTTCACAGTCATCATGAACTCAAGGCAATTGAAAAC  354

Query  445  TGCGAATATGCTTTTAATCTTAAAAAGGATGAAGTATGTGTAAACCCTTACCACTATCAGAGAGTTGAGACACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  TGCGAATATGCTTTTAATCTTAAAAAGGATGAAGTATGTGTAAACCCTTACCACTATCAGAGAGTTGAGACACC  428

Query  519  AGTTTTGCCTCCAGTATTAGTGCCCCGACACACCGAGATCCTAACAGAACTTCCGCCTCTGGATGACTATACTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  AGTTTTGCCTCCAGTATTAGTGCCCCGACACACCGAGATCCTAACAGAACTTCCGCCTCTGGATGACTATACTC  502

Query  593  ACTCCATTCCAGAAAACACTAACTTCCCAGCAGGAATTGAGCCACAGAGTAATTATATTCCAGAAACGCCACCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  ACTCCATTCCAGAAAACACTAACTTCCCAGCAGGAATTGAGCCACAGAGTAATTATATTCCAGAAACGCCACCT  576

Query  667  CCTGGATATATCAGTGAAGATGGAGAAACAAGTGACCAACAGTTGAATCAAAGTATGGACACAGGCTCTCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  CCTGGATATATCAGTGAAGATGGAGAAACAAGTGACCAACAGTTGAATCAAAGTATGGACACAGGCTCTCCAGC  650

Query  741  AGAACTATCTCCTACTACTCTTTCCCCTGTTAATCATAGCTTGGATTTACAGCCAGTTACTTACTCAGAACCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  AGAACTATCTCCTACTACTCTTTCCCCTGTTAATCATAGCTTGGATTTACAGCCAGTTACTTACTCAGAACCTG  724

Query  815  CATTTTGGTGTTCGATAGCATATTATGAATTAAATCAGAGGGTTGGAGAAACCTTCCATGCATCACAGCCCTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CATTTTGGTGTTCGATAGCATATTATGAATTAAATCAGAGGGTTGGAGAAACCTTCCATGCATCACAGCCCTCA  798

Query  889  CTCACTGTAGATGGCTTTACAGACCCATCAAATTCAGAGAGGTTCTGCTTAGGTTTACTCTCCAATGTTAACCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CTCACTGTAGATGGCTTTACAGACCCATCAAATTCAGAGAGGTTCTGCTTAGGTTTACTCTCCAATGTTAACCG  872

Query  963  AAATGCCACGGTAGAAATGACAAGAAGGCATATAGGAAGAGGAGTGCGCTTATACTACATAGGTGGGGAAGTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  AAATGCCACGGTAGAAATGACAAGAAGGCATATAGGAAGAGGAGTGCGCTTATACTACATAGGTGGGGAAGTTT  946

Query 1037  TTGCTGAGTGCCTAAGTGATAGTGCAATCTTTGTGCAGAGCCCCAATTGTAATCAGAGATATGGCTGGCACCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  TTGCTGAGTGCCTAAGTGATAGTGCAATCTTTGTGCAGAGCCCCAATTGTAATCAGAGATATGGCTGGCACCCT  1020

Query 1111  GCAACAGTGTGTAAAATTCCACCAGGCTGTAATCTGAAGATCTTCAACAACCAGGAATTTGCTGCTCTTCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  GCAACAGTGTGTAAAATTCCACCAGGCTGTAATCTGAAGATCTTCAACAACCAGGAATTTGCTGCTCTTCTGGC  1094

Query 1185  TCAGTCTGTTAATCAGGGTTTTGAAGCCGTCTATCAGCTAACTAGAATGTGCACCATAAGAATGAGTTTTGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  TCAGTCTGTTAATCAGGGTTTTGAAGCCGTCTATCAGCTAACTAGAATGTGCACCATAAGAATGAGTTTTGTGA  1168

Query 1259  AAGGGTGGGGAGCAGAATACCGAAGGCAGACGGTAACAAGTACTCCTTGCTGGATTGAACTTCATCTGAATGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  AAGGGTGGGGAGCAGAATACCGAAGGCAGACGGTAACAAGTACTCCTTGCTGGATTGAACTTCATCTGAATGGA  1242

Query 1333  CCTCTACAGTGGTTGGACAAAGTATTAACTCAGATGGGATCCCCTTCAGTGCGTTGCTCAAGCATGTCA  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  CCTCTACAGTGGTTGGACAAAGTATTAACTCAGATGGGATCCCCTTCAGTGCGTTGCTCAAGCATGTCA  1311