Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00973
• Subject: NM_001038609.2
• Aligned Length: 1330
• Identities: 968
• Gaps: 221

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGC----------------------  126
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||                      
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  127  ------------------------------------------------------------------CTGAA---  131
                                                                              |||||   
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGAC  189

Query  132  --------------------------------------------------------------------------  131
                                                                                      
Sbjct  190  GTGACTGCGCCCCTAGTGGATGAGAGAGCTCCCGACAAGCAGGCCGCTGCCCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  263

Query  132  ---------AGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC  196
                     |||.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  264  AGGAATTACAGCCGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTC  337

Query  197  AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAA  270
            |||||||..|||.|      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  338  AAGCTCGTGTGGCC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAA  405

Query  271  A------CGAAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGAT  338
            |      ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGAT  479

Query  339  TCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGC  411
            .||.||.||.|||.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  480  CCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGC  552

Query  412  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCAC  485
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  553  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCAC  626

Query  486  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGA  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....||||||||||||||||
Sbjct  627  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGA  700

Query  560  CAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAG  633
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG  774

Query  634  CCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAA  707
            ||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  775  CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAA  848

Query  708  GGATAATATCAAACACGTCCCGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGA  781
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  849  GGATAATATCAAACACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGA  922

Query  782  CCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAG  855
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  923  CCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAG  996

Query  856  CTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAA  929
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  997  CTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAA  1070

Query  930  TAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCG  1003
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1071  TAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTG  1144

Query 1004  TGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATC  1077
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1145  TGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATC  1218

Query 1078  GACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1149
            ||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1219  GACATGGTGGACTCACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1290