Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00986
• Subject: NM_008564.2
• Aligned Length: 2719
• Identities: 2382
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCGGAATCATCGGAATC-CT-TCACCATGGCATCCAGCCCGGCC---CAGCGTCGGCGAGGCAATGATCCT  69
            ||||||||.||.||.||.|| || |||     |||||.|||||.|||   |||||.||.||...||.||||||.
Sbjct    1  ATGGCGGAGTCTTCTGAGTCTCTCTCA-----GCATCTAGCCCTGCCCGTCAGCGGCGCCGGATCAGTGATCCC  69

Query   70  CTCACCTCCAGCCCTGGCCGAAGCTCCCGGCGTACTGATGCCCTCACCTCCAGCCCTGGCCGTGACCTTCCACC  143
            ||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||.||||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.||.||
Sbjct   70  CTCACCTCCAGCCCAGGCCGCAGCTCCAGACGTGCTGACGCCCTGACCTCCAGCCCTGGCAGAGACCTCCCCCC  143

Query  144  ATTTGAGGATGAGTCCGAGGGGCTCCTAGGCACAGAGGGGCCCCTGGAGGAAGAAGAGGATGGAGAGGAGCTCA  217
            ||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  144  ATTTGAAGATGAGTCTGAGGGGCTGCTGGGCACAGAGGGGCCCATGGAGGAAGAAGAGGATGGAGAGGAACTCA  217

Query  218  TTGGAGATGGCATGGAAAGGGACTACCGCGCCATCCCAGAGCTGGACGCCTATGAGGCCGAGGGACTGGCTCTG  291
            ||||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||.|||||.||.|.|||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct  218  TTGGTGATGGCATGGAGAGAGACTACCGTCCCATTCCGGAGCTCGATGTCTACGAGGCCGAGGGATTGGCCCTG  291

Query  292  GATGATGAGGACGTAGAGGAGCTGACGGCCAGTCAGAGGGAGGCAGCAGAGCGGGCCATGCGGCAGCGTGACCG  365
            ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||||.|||||||.|||||
Sbjct  292  GATGATGAAGATGTGGAGGAGCTGACAGCCAGTCAGAGAGAGGCAGCTGAGCGGACCATGAGGCAGCGGGACCG  365

Query  366  GGAGGCTGGCCGGGGCCTGGGCCGCATGCGCCGTGGGCTCCTGTATGACAGCGATGAGGAGGACGAGGAGCGCC  439
            .|||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||...|||||.||.||||||||.|
Sbjct  366  TGAGGCTGGCAGAGGCCTGGGACGCATGCGCCGGGGGCTGCTCTATGACAGCAGCGAGGAAGATGAGGAGCGGC  439

Query  440  CTGCCCGCAAGCGCCGCCAGGTGGAGCGGGCCACGGAGGACGGCGAGGAGGACGAGGAGATGATCGAGAGCATC  513
            |||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct  440  CTGCCCGTAAGCGCCGCCACGTAGAACGCGCCACAGAGGATGGCGAGGAGGATGAAGAGATGATCGAGAGTATT  513

Query  514  GAGAACCTGGAGGATCTCAAAGGCCACTCTGTGCGCGAGTGGGTGAGCATGGCGGGCCCCCGGCTGGAGATCCA  587
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||
Sbjct  514  GAGAATCTGGAGGACCTCAAGGGCCACTCGGTGCGCGAGTGGGTGAGCATGGCAGGGCCCAGGCTGGAGATCCA  587

Query  588  CCACCGCTTCAAGAACTTCCTGCGCACTCACGTCGACAGCCACGGCCACAACGTCTTCAAGGAGCGCATCAGCG  661
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  588  CCACCGCTTCAAGAACTTCCTGCGCACCCACGTGGACAGCCATGGCCACAACGTCTTCAAGGAGCGCATCAGTG  661

Query  662  ACATGTGCAAAGAGAACCGTGAGAGCCTGGTGGTGAACTATGAGGACTTGGCAGCCAGGGAGCACGTGCTGGCC  735
            |.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|||||.|||.||||||||.|||||||||||.||||.
Sbjct  662  ATATGTGCAAAGAGAACCGTGAGAGTTTGGTGGTAAATTATGAAGACCTGGCAGCCCGGGAGCACGTGTTGGCA  735

Query  736  TACTTCCTGCCTGAGGCACCGGCGGAGCTGCTGCAGATCTTTGATGAGGCTGCCCTGGAGGTGGTACTGGCCAT  809
            |||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..|||||||
Sbjct  736  TACTTCCTGCCGGAAGCACCGGCTGAGTTGCTGCAGATCTTTGACGAGGCTGCCCTGGAGGTCGTGTTGGCCAT  809

Query  810  GTACCCCAAGTACGACCGCATCACCAACCACATCCATGTCCGCATCTCCCACCTGCCTCTGGTGGAGGAGCTGC  883
            ||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  GTACCCTAAATATGACCGTATCACCAACCACATCCATGTGCGCATCTCCCACCTGCCTCTGGTGGAGGAGCTGC  883

Query  884  GCTCGCTGAGGCAGCTGCATCTGAACCAGCTGATCCGCACCAGTGGGGTGGTGACCAGCTGCACTGGCGTCCTG  957
            |.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  884  GTTCACTGAGGCAGTTGCACCTGAACCAGCTGATCCGTACCAGTGGCGTGGTGACCAGCTGCACCGGAGTCCTG  957

Query  958  CCCCAGCTCAGCATGGTCAAGTACAACTGCAACAAGTGCAATTTCGTCCTGGGTCCTTTCTGCCAGTCCCAGAA  1031
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  958  CCCCAGCTCAGCATGGTCAAGTACAACTGTAGCAAGTGCAACTTTGTACTGGGGCCTTTCTGCCAGTCTCAGAA  1031

Query 1032  CCAGGAGGTGAAACCAGGCTCCTGTCCTGAGTGCCAGTCGGCCGGCCCCTTTGAGGTCAACATGGAGGAGACCA  1105
            .|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TCAGGAGGTGAAGCCTGGCTCCTGCCCTGAGTGCCAGTCTGCTGGGCCCTTTGAGATCAACATGGAGGAGACCA  1105

Query 1106  TCTATCAGAACTACCAGCGTATCCGAATCCAGGAGAGTCCAGGCAAAGTGGCGGCTGGCCGGCTGCCCCGCTCC  1179
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1106  TCTATCAGAACTACCAACGTATCCGCATCCAGGAGAGTCCCGGCAAGGTGGCGGCTGGCCGACTGCCCCGTTCC  1179

Query 1180  AAGGACGCCATTCTCCTCGCAGATCTGGTGGACAGCTGCAAGCCAGGAGACGAGATAGAGCTGACTGGCATCTA  1253
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1180  AAGGATGCCATTCTCCTCGCTGATCTGGTGGACAGCTGCAAGCCAGGGGACGAGATAGAGCTGACCGGCATTTA  1253

Query 1254  TCACAACAACTATGATGGCTCCCTCAACACTGCCAATGGCTTCCCTGTCTTTGCCACTGTCATCCTAGCCAACC  1327
            .||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||.|.|||||||
Sbjct 1254  CCATAATAACTATGACGGCTCGCTTAACACCGCCAACGGCTTTCCAGTCTTTGCCACTATTATCTTGGCCAACC  1327

Query 1328  ACGTGGCCAAGAAGGACAACAAGGTTGCTGTAGGGGAACTGACCGATGAAGATGTGAAGATGATCACTAGCCTC  1401
            |.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||..|.|||
Sbjct 1328  ATGTTGCCAAGAAGGACAACAAAGTAGCTGTGGGGGAGCTCACCGATGAGGACGTGAAGATGATCACCGGTCTC  1401

Query 1402  TCCAAGGATCAGCAGATCGGAGAGAAGATCTTTGCCAGCATTGCTCCTTCCATCTATGGTCATGAAGACATCAA  1475
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1402  TCCAAGGATCAGCAAATTGGAGAGAAGATCTTTGCCAGCATTGCACCCTCCATCTATGGGCATGAAGACATCAA  1475

Query 1476  GAGAGGCCTGGCTCTGGCCCTGTTCGGAGGGGAGCCCAAAAACCCAGGTGGCAAGCACAAGGTACGTGGTGATA  1549
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1476  GAGAGGCCTGGCTCTGGCCCTGTTTGGAGGGGAGCCCAAGAACCCAGGTGGAAAGCACAAGGTTCGAGGTGACA  1549

Query 1550  TCAACGTGCTCTTGTGCGGAGACCCTGGCACAGCGAAGTCGCAGTTTCTCAAGTATATTGAGAAAGTGTCCAGC  1623
            |.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1550  TTAATGTGCTCTTGTGTGGGGACCCTGGCACAGCAAAGTCCCAATTCCTCAAATACATCGAGAAAGTGTCTAGC  1623

Query 1624  CGAGCCATCTTCACCACTGGCCAGGGGGCGTCGGCTGTGGGCCTCACGGCGTATGTCCAGCGGCACCCTGTCAG  1697
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1624  CGTGCCATCTTCACCACTGGCCAGGGTGCGTCAGCAGTGGGTCTCACCGCGTACGTTCAGCGGCATCCCGTCAG  1697

Query 1698  CAGGGAGTGGACCTTGGAGGCTGGGGCCCTGGTTCTGGCTGACCGAGGAGTGTGTCTCATTGATGAATTTGACA  1771
            |||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1698  CAGAGAGTGGACCTTAGAGGCGGGAGCCCTGGTTCTGGCTGACCGGGGGGTGTGTCTCATTGACGAGTTTGACA  1771

Query 1772  AGATGAATGACCAGGACAGAACCAGCATCCATGAGGCCATGGAGCAACAGAGCATCTCCATCTCGAAGGCTGGC  1845
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1772  AGATGAATGACCAGGACAGGACCAGCATCCACGAGGCCATGGAACAGCAAAGCATCTCCATCTCCAAGGCTGGC  1845

Query 1846  ATCGTCACCTCCCTGCAGGCTCGCTGCACGGTCATTGCTGCCGCCAACCCCATAGGAGGGCGCTACGACCCCTC  1919
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1846  ATCGTTACCTCGCTGCAAGCCCGCTGCACTGTCATAGCTGCTGCCAACCCCATAGGAGGCCGCTACGACCCTTC  1919

Query 1920  GCTGACTTTCTCTGAGAACGTGGACCTCACAGAGCCCATCATCTCACGCTTTGACATCCTGTGTGTGGTGAGGG  1993
            .|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 1920  ACTGACCTTCTCAGAGAATGTAGACCTCACAGAGCCCATCATTTCCCGCTTTGATGTCCTGTGTGTGGTGAGGG  1993

Query 1994  ACACCGTGGACCCAGTCCAGGACGAGATGCTGGCCCGCTTCGTGGTGGGCAGCCACGTCAGACACCACCCCAGC  2067
            ||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1994  ACACTGTTGATCCAGTTCAGGATGAGATGCTGGCCCGCTTTGTGGTTGGCAGCCACGTCAGACACCACCCCAGT  2067

Query 2068  AACAAGGAGGAGGAGGGGCTGGCCAATGGCAGCGCTGCT--GAGCCCGCCATGCCCAACACGTATGGCGTGGAG  2139
            ||||||.||||.||.|||.||.|.|||||..||.|  ||  |||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2068  AACAAGAAGGATGAAGGGTTGACTAATGGTGGCAC--CTTGGAGCCAGCCATGCCCAACACATATGGCGTGGAG  2139

Query 2140  CCCCTGCCCCAGGAGGTCCTGAAGAAGTACATCATCTACGCCAAGGAGAGGGTCCACCCGAAGCTCAACCAGAT  2213
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2140  CCCCTGCCTCAGGAGGTGCTGAAGAAGTATATCATCTATGCCAAGGAGAGGGTCCGCCCGAAGCTCAACCAGAT  2213

Query 2214  GGACCAGGACAAGGTGGCCAAGATGTACAGTGACCTGAGGAAAGAATCTATGGCGACAGGCAGCATCCCCATTA  2287
            |||||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2214  GGACCAGGATAAAGTGGCCAGGATGTACAGTGACCTGAGGAAGGAGTCCATGGCAACGGGCAGCATTCCCATCA  2287

Query 2288  CGGTGCGGCACATCGAGTCCATGATCCGCATGGCGGAGGCCCACGCGCGCATCCATCTGCGGGACTATGTGATC  2361
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 2288  CGGTGCGCCACATCGAGTCCATGATCCGCATGGCCGAGGCCCATGCCCGCATGCACCTGCGGGACTACGTGATG  2361

Query 2362  GAAGACGACGTCAACATGGCCATCCGCGTGATGCTGGAGAGCTTCATAGACACACAGAAGTTCAGCGTCATGCG  2435
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2362  GAAGACGATGTCAACATGGCCATCCGAGTGATGATGGAGAGCTTCATTGACACCCAGAAGTTCAGCGTCATGCG  2435

Query 2436  CAGCATGCGCAAGACTTTTGCCCGCTACCTTTCATTCCGGCGTGACAACAATGAGCTGTTGCTCTTCATACTGA  2509
            .||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 2436  GAGTATGCGCAAGACTTTTGCCCGGTATCTCTCCTTCCGGCGAGATAACAATGATCTGCTGCTCTTCATACTGA  2509

Query 2510  AGCAGTTAGTGGCAGAGCAGGTGACATATCAGCGCAACCGCTTTGGGGCCCAGCAGGACACTATTGAGGTCCCT  2583
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||
Sbjct 2510  AGCAGTTGGTGGCTGAGCAGGTGACATATCAACGCAACCGCTTTGGGGCCCAGCAGGACACCATTGAAATACCT  2583

Query 2584  GAGAAGGACTTGGTGGATAAGGCTCGTCAGATCAACATCCACAACCTCTCTGCATTTTATGACAGTGAGCTCTT  2657
            ||||||||..||.||||.|||||..|.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 2584  GAGAAGGATCTGATGGACAAGGCCAGGCAGATCAATATTCACAACCTCTCTGCCTTCTACGACAGCGACCTCTT  2657

Query 2658  CAGGATGAACAAGTTCAGCCACGACCTGAAAAGGAAAATGATCCTGCAGCAGTTC  2712
            ||...|.|||||||||||||..|||||||||.|.|||.|||||||.|||||||||
Sbjct 2658  CAAATTCAACAAGTTCAGCCGTGACCTGAAACGCAAACTGATCCTACAGCAGTTC  2712