Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00998
- Subject:
- NM_001159570.2
- Aligned Length:
- 1423
- Identities:
- 1097
- Gaps:
- 257
Alignment
Query 1 ATGGCGCAAAG-----GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG 69
|.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG 66
Query 70 TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC 143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC 140
Query 144 ACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCT 217
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 141 GCAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCT 214
Query 218 TGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAG 291
||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 215 TGAAAAGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAG 288
Query 292 CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGA 365
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 289 CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGA 362
Query 366 CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGA 439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 363 CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGA 436
Query 440 TGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTC 513
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 437 TGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTC 510
Query 514 TGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTC 587
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 511 TGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTC 584
Query 588 CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACC 661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 585 CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACC 658
Query 662 ACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGA 735
|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 659 ACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGA 732
Query 736 GACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCC 809
||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 733 GACAACAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCC 806
Query 810 GGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGC 883
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 807 AGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGC 880
Query 884 TCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACA 957
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 881 TCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACA 954
Query 958 ATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG 1031
|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 ATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG 1028
Query 1032 AGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAAC 1105
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 AGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAAC 1102
Query 1106 ACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAAT 1178
||||||||||||||||||||| || .|||| ||.||| |||||.||
Sbjct 1103 ACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--AGTGGA----------------------ATGGGCAT 1145
Query 1179 GAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGA 1245
||.||||| .|| || |||..|||| |.|||
Sbjct 1146 GAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT-------ATATG------------------------------ 1179
Query 1246 CCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCA 1319
Sbjct 1180 -------------------------------------------------------------------------- 1179
Query 1320 CCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTA 1393
Sbjct 1180 -------------------------------------------------------------------------- 1179
Query 1394 TGGACATTCATGCCCAA 1410
Sbjct 1180 ----------------- 1179