Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00998
• Subject: NM_001346038.1
• Aligned Length: 1436
• Identities: 1336
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAG-----GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  69
                    |.|     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  66

Query   70  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  140

Query  144  ACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCT  217
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  141  GCAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCT  214

Query  218  TGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAG  291
            ||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  215  TGAAAAGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAG  288

Query  292  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGA  365
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  289  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGA  362

Query  366  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGA  439
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  363  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGA  436

Query  440  TGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTC  513
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  437  TGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTC  510

Query  514  TGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTC  587
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  511  TGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTC  584

Query  588  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACC  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  585  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACC  658

Query  662  ACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGA  735
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  659  ACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGA  732

Query  736  GACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCC  809
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  733  GACAACAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCC  806

Query  810  GGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGC  883
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  807  AGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGC  880

Query  884  TCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACA  957
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  881  TCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACA  954

Query  958  ATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG  1031
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  ATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG  1028

Query 1032  AG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCT  1084
            ||                     |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  AGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCT  1102

Query 1085  TTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCT  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCT  1176

Query 1159  CAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCA  1232
            |||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  CAGGGTGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCA  1250

Query 1233  ATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAG  1306
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1251  GTTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAG  1324

Query 1307  GACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTT  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  GACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTT  1398

Query 1381  GGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  GGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1428