Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00998
• Subject: XM_011239337.2
• Aligned Length: 1682
• Identities: 1339
• Gaps: 277

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGCGCAAAGG----  12
                                                                      ||     |||.|    
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAAT-----AAACGAGAA  69

Query   13  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  143

Query   87  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGC  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGC  217

Query  161  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGAC  234
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct  218  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGAC  291

Query  235  GCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  308
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  365

Query  309  CCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  382
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  439

Query  383  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAA  456
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  440  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAA  513

Query  457  GTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAG  530
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  GTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAG  587

Query  531  CTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  604
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  661

Query  605  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCA  678
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  662  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCA  735

Query  679  ACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA  752
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCA  809

Query  753  --------------------------------------------------------------------------  752
                                                                                      
Sbjct  810  AGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAGGATGCGTTTCAG  883

Query  753  --------------------------------------------------------------------------  752
                                                                                      
Sbjct  884  TGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTTGAAAACATCATC  957

Query  753  -----------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACC  785
                                                     |||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  958  ATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACC  1031

Query  786  TGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAG  859
            |||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1032  TGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCG  1105

Query  860  CAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAG  933
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1106  CGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAG  1179

Query  934  TTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACA  1007
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1180  TTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCA  1253

Query 1008  GCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTC  1060
            ||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1254  GCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTC  1327

Query 1061  CAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAG  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  CAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAG  1401

Query 1135  AGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCC  1208
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  AGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCAGCCAAGTTACACTCCTCC  1475

Query 1209  CCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACC  1282
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  CCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACC  1549

Query 1283  ACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATG  1356
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  ACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATG  1623

Query 1357  TTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624  TTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1677