Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00998
- Subject:
- XM_017316108.1
- Aligned Length:
- 1690
- Identities:
- 1100
- Gaps:
- 521
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGGCGCAAAGG---- 12
|| |||.|
Sbjct 1 ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAAT-----AAACGAGAA 69
Query 13 TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC 143
Query 87 GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGC 160
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 144 GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGC 217
Query 161 ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGAC 234
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct 218 ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGAC 291
Query 235 GCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC 308
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC 365
Query 309 CCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA 382
|||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 CCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA 439
Query 383 AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAA 456
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 440 AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAA 513
Query 457 GTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAG 530
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 514 GTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAG 587
Query 531 CTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG 604
||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 CTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG 661
Query 605 AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCA 678
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 662 AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCA 735
Query 679 ACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA 752
||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 736 ACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCA 809
Query 753 -------------------------------------------------------------------------- 752
Sbjct 810 AGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAGGATGCGTTTCAG 883
Query 753 -------------------------------------------------------------------------- 752
Sbjct 884 TGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTTGAAAACATCATC 957
Query 753 -----------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACC 785
|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 958 ATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACC 1031
Query 786 TGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAG 859
|||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1032 TGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCG 1105
Query 860 CAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAG 933
|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1106 CGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAG 1179
Query 934 TTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACA 1007
||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1180 TTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCA 1253
Query 1008 GCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTC 1060
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1254 GCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTC 1327
Query 1061 CAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAG 1134
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1328 CAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------G 1394
Query 1135 A-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA-------GCCAAGTTAC 1200
| .|||| ||.||| |||||.||||.||||| .|| || |||..|
Sbjct 1395 ACCCATG--AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGC 1441
Query 1201 ACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCA 1274
||| |.|||
Sbjct 1442 ACT-------ATATG----------------------------------------------------------- 1449
Query 1275 TCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCC 1348
Sbjct 1450 -------------------------------------------------------------------------- 1449
Query 1349 CCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA 1410
Sbjct 1450 -------------------------------------------------------------- 1449
