Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00998
• Subject: XM_017316114.1
• Aligned Length: 1607
• Identities: 1106
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74

Query   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC  148

Query  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA  222

Query  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296
            .|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296

Query  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370

Query  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA  444

Query  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA  518

Query  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT  592

Query  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT  666

Query  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA  740

Query  741  CAGCAGTGAGCA--------------------------------------------------------------  752
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  741  CAGCAGTGAGCAAGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAG  814

Query  753  --------------------------------------------------------------------------  752
                                                                                      
Sbjct  815  GATGCGTTTCAGTGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTT  888

Query  753  -----------------------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAG  773
                                                                 |||.|||||.|||||||||||
Sbjct  889  GAAAACATCATCATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAG  962

Query  774  TGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTT  847
            .||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  CGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATAT  1036

Query  848  TCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAG  921
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1037  TCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAA  1110

Query  922  CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAG  995
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAG  1184

Query  996  AAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTC  1069
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTC  1258

Query 1070  AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCC  1142
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || .||||  
Sbjct 1259  AGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--  1323

Query 1143  AGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCC  1209
            ||.|||                      |||||.||||.||||| .||       ||  |||..||||      
Sbjct 1324  AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT------  1366

Query 1210  CAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCA  1283
             |.|||                                                                    
Sbjct 1367  -ATATG--------------------------------------------------------------------  1371

Query 1284  CCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGT  1357
                                                                                      
Sbjct 1372  --------------------------------------------------------------------------  1371

Query 1358  TAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
                                                                 
Sbjct 1372  -----------------------------------------------------  1371