Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00998
• Subject: XM_017316117.1
• Aligned Length: 1501
• Identities: 1100
• Gaps: 332

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGCGCAAAGG----  12
                                                                      ||     |||.|    
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAAT-----AAACGAGAA  69

Query   13  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  143

Query   87  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGC  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGC  217

Query  161  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGAC  234
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct  218  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGAC  291

Query  235  GCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  308
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  365

Query  309  CCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  382
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  439

Query  383  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAA  456
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  440  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAA  513

Query  457  GTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAG  530
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  GTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAG  587

Query  531  CTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  604
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  661

Query  605  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCA  678
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  662  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCA  735

Query  679  ACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA  752
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCA  809

Query  753  AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAAC  826
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  810  AGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAAC  883

Query  827  GCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACA  900
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACA  957

Query  901  CATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAA  974
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  958  CACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAA  1031

Query  975  CTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------  1033
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1032  CTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTG  1105

Query 1034  ------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAG  1101
                  |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAG  1179

Query 1102  CAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGG  1174
            |||||||||||||||||||||||||       || .||||  ||.|||                      ||||
Sbjct 1180  CAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--AGTGGA----------------------ATGG  1222

Query 1175  GAATGAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACA  1241
            |.||||.||||| .||       ||  |||..||||       |.|||                          
Sbjct 1223  GCATGAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT-------ATATG--------------------------  1260

Query 1242  TGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTA  1315
                                                                                      
Sbjct 1261  --------------------------------------------------------------------------  1260

Query 1316  CCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAG  1389
                                                                                      
Sbjct 1261  --------------------------------------------------------------------------  1260

Query 1390  GTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
                                 
Sbjct 1261  ---------------------  1260