Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00999
- Subject:
- NM_001346044.1
- Aligned Length:
- 1389
- Identities:
- 1080
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGA 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGA 74
Query 39 CCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACT 112
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACT 148
Query 113 ACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGG 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 149 ACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGA 222
Query 187 GACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGAC 260
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGAC 296
Query 261 CTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGG 334
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGG 370
Query 335 TCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAA 408
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAA 444
Query 409 GCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCG 482
|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCG 518
Query 483 ATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAG 556
.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 519 GTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAG 592
Query 557 ATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGAT 630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 ATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGAC 666
Query 631 GCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAG 704
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAG 740
Query 705 CAGTGAGCA----------------------------------------------------------------- 713
|||||||||
Sbjct 741 CAGTGAGCAAGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAGGAT 814
Query 714 -------------------------------------------------------------------------- 713
Sbjct 815 GCGTTTCAGTGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTTGAA 888
Query 714 --------------------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGT 737
|||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 889 AACATCATCATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGT 962
Query 738 AGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCC 811
||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 AGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCC 1036
Query 812 CCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAG 885
|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1037 CCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAG 1110
Query 886 AAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAG 959
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAG 1184
Query 960 AATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAG 1012
||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAG 1258
Query 1013 CATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCA 1086
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCA 1332
Query 1087 GGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG 1143
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1333 GGACCCATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATATG 1389