Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00999
• Subject: NM_001346056.1
• Aligned Length: 1143
• Identities: 862
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296
               .|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ---ATGGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGA  71

Query  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   72  CGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTT  145

Query  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  146  TTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTA  219

Query  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  220  GAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGA  293

Query  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592
            ||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  367

Query  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666
            |.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  368  CCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCC  441

Query  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  442  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGC  515

Query  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814
            |||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  516  TTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCA  589

Query  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888
            ||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  590  AAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAG  663

Query  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  664  AAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAAT  737

Query  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  1036
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  AGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  811

Query 1037  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  812  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCCATGAGTGGAATGGGCATG  885

Query 1111  AATATGGGCATGGATGGGCAATGGCACTACATG  1143
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  886  AATATGGGCATGGATGGGCAGTGGCACTATATG  918