Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00999
• Subject: NM_170677.5
• Aligned Length: 1203
• Identities: 1143
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74

Query   36  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148

Query  110  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222

Query  184  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296

Query  258  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370

Query  332  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444

Query  406  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518

Query  480  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592

Query  554  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666

Query  628  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740

Query  702  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814

Query  776  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888

Query  850  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962

Query  924  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---  994
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  1036

Query  995  ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1050
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1110

Query 1051  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGA  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGA  1184

Query 1125  TGGGCAATGGCACTACATG  1143
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGGCAATGGCACTACATG  1203