Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00999
• Subject: XM_017316107.1
• Aligned Length: 1473
• Identities: 1066
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAATAAACGAGAATACGA  74

Query    1  ----------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  148

Query   53  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCC  126
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGCACGCC  222

Query  127  CCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGAT  200
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct  223  CCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGACGCAAT  296

Query  201  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  370

Query  275  AACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  348
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  444

Query  349  GTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACT  422
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACT  518

Query  423  AAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTT  496
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTT  592

Query  497  TGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  570
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  666

Query  571  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCA  644
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCA  740

Query  645  CTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGG  718
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCG  814

Query  719  ATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAG  792
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAG  888

Query  793  AAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCC  866
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCC  962

Query  867  GTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGT  940
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  GTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGT  1036

Query  941  TTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCA  1014
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCG  1110

Query 1015  TATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCA--  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1111  TATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGG  1184

Query 1087  ------------------GGAC-------CTATGAGTGG---AATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGCAA  1131
                              ||||       ||..|.||||   ||||||.|||..||||| .||      |.|||
Sbjct 1185  TTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCA------GCCAA  1252

Query 1132  -TGGCACT-------ACATG------------------------------------------------------  1143
             |..||||       |.|||                                                      
Sbjct 1253  GTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCA  1326

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1327  AGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACA  1400

Query 1144  -------------------------------------------------------------------  1143
                                                                               
Sbjct 1401  GAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1467