Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00999
• Subject: XM_017316109.1
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1080
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAATAAACGAGAATACGA  74

Query    1  ----------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  148

Query   53  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCC  126
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGCACGCC  222

Query  127  CCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGAT  200
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct  223  CCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGACGCAAT  296

Query  201  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  370

Query  275  AACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  348
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  444

Query  349  GTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACT  422
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACT  518

Query  423  AAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTT  496
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTT  592

Query  497  TGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  570
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  666

Query  571  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCA  644
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCA  740

Query  645  CTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA-----  713
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||     
Sbjct  741  CTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCG  814

Query  714  --------------------------------------------------------------------------  713
                                                                                      
Sbjct  815  CTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCGCACAGGATGCGTTTCAGTGCAA  888

Query  714  --------------------------------------------------------------------------  713
                                                                                      
Sbjct  889  ATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAACCACTTGAAAACATCATCATTCC  962

Query  714  ------------------------------------AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTA  751
                                                |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  CTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCA  1036

Query  752  CAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACA  825
            |||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  CAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACA  1110

Query  826  AATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGC  899
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGC  1184

Query  900  GCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCA  973
            |||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  GCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCA  1258

Query  974  TGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTT  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTT  1332

Query 1048  GTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCAT  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGACCCATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCAT  1406

Query 1122  GGATGGGCAATGGCACTACATG  1143
            |||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1407  GGATGGGCAGTGGCACTATATG  1428