Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00999
• Subject: XM_024449927.1
• Aligned Length: 1378
• Identities: 1127
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74

Query   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148

Query  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222

Query  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296

Query  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370

Query  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444

Query  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518

Query  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592

Query  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666

Query  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740

Query  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814

Query  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888

Query  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962

Query  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCA  1036

Query 1037  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCTATG--AGTGGA  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||.| |||  ||.|||
Sbjct 1037  TGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGC-ATGCCAGGGGA  1109

Query 1102  ----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGCAA-TGGCACT-------ACATG-  1143
                                  |||||.||||.||||| .||      |.||| |..||||       |.||| 
Sbjct 1110  CTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGA  1177

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1178  CCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCC  1251

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1252  ATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTC  1325

Query 1144  ----------------------------------------------  1143
                                                          
Sbjct 1326  TGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1371