Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01001
• Subject: NM_001253901.1
• Aligned Length: 1005
• Identities: 876
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGGTGCGCCGAGATCGCCTCCGCAGGATGAGGGAGTGGTGGGTCCAGGTGGGGCTGCTGGCCGTGCCCCTGCT  74
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGAGGGAGTGGTGGGTCCAGGTGGGGCTGCTGGCCGTGCCCCTGCT  47

Query   75  TGCTGCGTACCTGCACATCCCACCCCCTCAGCTCTCCCCTGCCCTTCACTCATGGAAGTCTTCAGGCAAGTTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  TGCTGCGTACCTGCACATCCCACCCCCTCAGCTCTCCCCTGCCCTTCACTCATGGAAGTCTTCAGGCAAGTTTT  121

Query  149  TCACTTACAAGGGACTGCGTATCTTCTACCAAGACTCTGTGGGTGTGGTTGGAAGTCCAGAGATAGTTGTGCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  TCACTTACAAGGGACTGCGTATCTTCTACCAAGACTCTGTGGGTGTGGTTGGAAGTCCAGAGATAGTTGTGCTT  195

Query  223  TTACACGGTTTTCCAACATCCAGCTACGACTGGTACAAGATTTGGGAAGGTCTGACCTTGAGGTTTCATCGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  TTACACGGTTTTCCAACATCCAGCTACGACTGGTACAAGATTTGGGAAGGTCTGACCTTGAGGTTTCATCGGGT  269

Query  297  GATTGCCCTTGATTTCTTAGGCTTTGGCTTCAGTGACAAACCGAGACCACATCACTATTCCATATTTGAGCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GATTGCCCTTGATTTCTTAGGCTTTGGCTTCAGTGACAAACCGAGACCACATCACTATTCCATATTTGAGCAGG  343

Query  371  CCAGCATCGTGGAAGCGCTTTTGCGGCATCTGGGGCTCCAGAACCGCAGGATCAACCTTCTTTCTCATGACTAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  CCAGCATCGTGGAAGCGCTTTTGCGGCATCTGGGGCTCCAGAACCGCAGGATCAACCTTCTTTCTCATGACTAT  417

Query  445  GGAGATATTGTTGCTCAGGAGCTTCTCTACAGGTACAAGCAGAATCGATCTGGTCGGCTTACCATAAAGAGTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GGAGATATTGTTGCTCAGGAGCTTCTCTACAGGTACAAGCAGAATCGATCTGGTCGGCTTACCATAAAGAGTCT  491

Query  519  CTGTCTGTCAAATGGAGGTATCTTTCCTGAGACTCACCGTCCACTCCTTCTCCAAAAGCTACTCAAAGATGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CTGTCTGTCAAATGGAGGTATCTTTCCTGAGACTCACCGTCCACTCCTTCTCCAAAAGCTACTCAAAGATGGAG  565

Query  593  GTGTGCTGTCACCCATCCTCACACGACTGATGAACTTCTTTGTATTCTCTCGAGGTCTCACCCCAGTCTTTGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  566  GTGTGCTGTCACCCATCCTCACACGACTGATGAACTTCTTTGTATTCTCTCGAG--------------------  619

Query  667  CCGTATACTCGGCCCTCTGAGAGTGAGCTGTGGGACATGTGGGCAGGGATCCGCAACAATGACGGGAACTTAGT  740
                                                                                      
Sbjct  620  --------------------------------------------------------------------------  619

Query  741  CATTGACAGTCTCTTACAGTACATCAATCAGAGGAAGAAGTTCAGAAGGCGCTGGGTGGGAGCTCTTGCCTCTG  814
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  --------GTCTCTTACAGTACATCAATCAGAGGAAGAAGTTCAGAAGGCGCTGGGTGGGAGCTCTTGCCTCTG  685

Query  815  TAACTATCCCCATTCATTTTATCTATGGGCCATTGGATCCTGTAAATCCCTATCCAGAGTTTTTGGAGCTGTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TAACTATCCCCATTCATTTTATCTATGGGCCATTGGATCCTGTAAATCCCTATCCAGAGTTTTTGGAGCTGTAC  759

Query  889  AGGAAAACGCTGCCGCGGTCCACAGTGTCGATTCTGGATGACCACATTAGCCACTATCCACAGCTAGAGGATCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  AGGAAAACGCTGCCGCGGTCCACAGTGTCGATTCTGGATGACCACATTAGCCACTATCCACAGCTAGAGGATCC  833

Query  963  CATGGGCTTCTTGAATGCATATATGGGCTTCATCAACTCCTTC  1005
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  CATGGGCTTCTTGAATGCATATATGGGCTTCATCAACTCCTTC  876