Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01006
• Subject: XM_006520554.3
• Aligned Length: 1615
• Identities: 1388
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCCGGCCTGTGCCTCATCTCCTTCCTGCACTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCTGGCCTGTGCCTCATATCCTTCCTGCACTT  74

Query   75  CTTCAAGACCCTGTCCTATGTCACCTTCCCCCGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTGGTGTCCAGCTTTT  148
            |||.||||||.|.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct   75  CTTTAAGACCTTATCCTATGTCACCTTCCCGAGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTCGTATCCAGCTTCT  148

Query  149  TCTGGAACAATGCCCCGGTCACGCCCCAGGCCAGCCCCGAGCCAGGAGGCCCTGACCTGCTGCGTACCCCACTC  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||..||||.||.||.|||
Sbjct  149  TCTGGAACAATGCCCCTGTCACTCCCCAGGCCAGTCCGGAGCCGGGTGGCCCCGACCTATTGCGGACACCCCTC  222

Query  223  TACTCCCACTCGCCCCTGCTGCAGCCGCTGCCGCCCAGCAAGGCGGCCGAGGAGCTCCACCGGGTGGACTTGGT  296
            |||||||||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||..|.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  TACTCCCACTCTCCCCTGCTCCAGCCACTGTCCCCGAGCAAGGCCACAGAGGAACTGCACCGGGTGGACTTCGT  296

Query  297  GCTGCCCGAGGACACCACCGAGTATTTCGTGCGCACCAAGGCCGGCGGCGTCTGCTTCAAACCCGGCACCAAGA  370
            |.||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||.||
Sbjct  297  GTTGCCGGAGGACACCACGGAGTATTTTGTGCGCACCAAAGCTGGTGGTGTGTGCTTCAAACCAGGTACCAGGA  370

Query  371  TGCTGGAGAGGCCGCCCCCGGGACGGCCGGAGGAGAAGCCTGAGGGGGCCAACGGCTCCTCGGCCCGGCGGCCA  444
            |||||||||..||..|.||.||.|||.|.|||||||||||.||.|.|.|..|.||||||||.||||||.|.||.
Sbjct  371  TGCTGGAGAAACCTTCGCCAGGGCGGACAGAGGAGAAGCCCGAAGTGTCTGAGGGCTCCTCAGCCCGGGGACCT  444

Query  445  CCCC------------GGTACCTCCTGAGCGCCCGGGAGCGCACGGGGGGCCGAGGCGCCCGGCGCAAGTGGGT  506
            .|.|            ||.||.|..||||..|.|||||||||..|||..||||.|||.|..|||||||||||||
Sbjct  445  GCTCGGAGGCCCATGAGGCACGTGTTGAGTACGCGGGAGCGCCTGGGCAGCCGGGGCACTAGGCGCAAGTGGGT  518

Query  507  GGAGTGCGTGTGCCTGCCCGGCTGGCACGGACCCAGCTGCGGCGTGCCCACTGTGGTGCAGTACTCCAACCTGC  580
            .|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TGAGTGTGTGTGCCTGCCAGGCTGGCACGGGCCCAGTTGCGGGGTGCCCACGGTGGTGCAGTATTCCAACCTGC  592

Query  581  CCACCAAGGAGCGGCTGGTGCCCAGGGAGGTGCCGCGCCGCGTCATCAACGCCATCAACGTCAACCACGAGTTC  654
            ||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  593  CCACCAAGGAACGCCTGGTACCCAGGGAGGTACCGAGGCGGGTTATCAACGCCATCAACATCAACCACGAGTTC  666

Query  655  GACCTGCTGGACGTGCGCTTCCACGAGCTGGGCGACGTGGTGGACGCCTTTGTGGTGTGCGAGTCCAACTTCAC  728
            |||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct  667  GACCTGCTGGATGTGCGTTTCCATGAGCTGGGAGATGTTGTGGACGCCTTCGTGGTCTGTGAATCTAATTTCAC  740

Query  729  GGCTTATGGGGAGCCGCGGCCGCTCAAGTTCCGGGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCACA  802
            .||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCTACGGGGAGCCTCGGCCGCTCAAGTTCCGAGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCACA  814

Query  803  AGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCACTTCCCGCCCGGCGGCCGGCAGGACGGCTGGATCGCCGACGACTACCTG  876
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  815  AGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCATTTCCCACCTGGTGGCCGTCAGGACGGCTGGATTGCGGATGACTACCTG  888

Query  877  CGCACCTTCCTCACCCAGGACGGCGTCTCGCGGCTGCGCAACCTGCGGCCCGACGACGTCTTCATCATTGACGA  950
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  889  CGCACCTTCCTCACCCAGGATGGCGTCTCCCGCCTGCGCAACCTGCGGCCCGATGACGTCTTTATCATCGACGA  962

Query  951  TGCGGACGAGATCCCGGCCCGTGACGGCGTCCTTTTCCTCAAGCTCTACGATGGCTGGACCGAGCCCTTCGCCT  1024
            |||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  TGCGGACGAGATCCCTGCGCGTGATGGTGTGCTGTTCCTCAAACTCTACGATGGCTGGACAGAGCCCTTCGCCT  1036

Query 1025  TCCACATGCGCAAGTCGCTCTACGGCTTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACCCTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACG  1098
            ||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TCCACATGCGGAAGTCCCTGTATGGTTTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACACTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACC  1110

Query 1099  GTGGACATGCTGCAGGCAGTGTATGGGCTGGACGGCATCCGCCTGCGCCGCCGCCAGTACTACACCATGCCCAA  1172
            .||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGACATGCTGCAGGCCGTGTATGGGCTGGATGGCATCCGCCTGCGCCGCCGCCAGTACTACACCATGCCCAA  1184

Query 1173  CTTCAGACAGTATGAGAACCGCACCGGCCACATCCTGGTGCAGTGGTCGCTGGGCAGCCCCCTGCACTTCGCCG  1246
            ||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CTTCCGGCAGTATGAGAACCGCACCGGCCACATCCTAGTGCAGTGGTCTCTCGGCAGCCCCCTGCACTTCGCGG  1258

Query 1247  GCTGGCACTGCTCCTGGTGCTTCACGCCCGAGGGCATCTACTTCAAGCTCGTGTCCGCCCAGAATGGCGACTTC  1320
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTGGCATTGCTCCTGGTGCTTCACACCCGAGGGCATCTACTTTAAACTCGTGTCAGCCCAGAATGGCGACTTC  1332

Query 1321  CCACGCTGGGGTGACTACGAGGACAAGCGGGACCTGAACTACATCCGCGGCCTGATCCGCACCGGGGGCTGGTT  1394
            ||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  CCCCGCTGGGGTGACTATGAGGACAAGAGGGACCTCAATTACATCCGCAGCTTGATCCGCACTGGGGGATGGTT  1406

Query 1395  CGACGGCACGCAGCAGGAGTACCCGCCTGCAGACCCCAGCGAGCACATGTATGCGCCCAAGTACCTGCTGAAGA  1468
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 1407  CGACGGAACGCAGCAGGAGTACCCTCCTGCGGACCCCAGTGAGCACATGTATGCTCCTAAATACCTGCTCAAGA  1480

Query 1469  ACTACGACCGGTTCCACTACCTGCTGGACAACCCCTACCAGGAGCCCAGGAGCACGGCGGCGGGCGGGTGGCGC  1542
            ||||.||||.|||||.||||.|||||||.||.|||||||.||||||||.||||||.|..|.|||.|||.|.||.
Sbjct 1481  ACTATGACCAGTTCCGCTACTTGCTGGAAAATCCCTACCGGGAGCCCAAGAGCACTGAAGAGGGTGGGCGCCGG  1554

Query 1543  CA-CAGGGGTCCCGAGGGAAGGCCGCCCGC---CCGGGGCAAACTGGACGAGGCGGAAGTC  1599
            .| |||||.| |.||.||||||||..|.||   |.|||||||..||||....|.|||.|.|
Sbjct 1555  AACCAGGGCT-CAGATGGAAGGCCATCTGCTGTCAGGGGCAAGTTGGATACAGTGGAGGGC  1614