Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01006
- Subject:
- XM_006520556.3
- Aligned Length:
- 1615
- Identities:
- 1388
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCCGGCCTGTGCCTCATCTCCTTCCTGCACTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCTGGCCTGTGCCTCATATCCTTCCTGCACTT 74
Query 75 CTTCAAGACCCTGTCCTATGTCACCTTCCCCCGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTGGTGTCCAGCTTTT 148
|||.||||||.|.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 75 CTTTAAGACCTTATCCTATGTCACCTTCCCGAGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTCGTATCCAGCTTCT 148
Query 149 TCTGGAACAATGCCCCGGTCACGCCCCAGGCCAGCCCCGAGCCAGGAGGCCCTGACCTGCTGCGTACCCCACTC 222
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||..||||.||.||.|||
Sbjct 149 TCTGGAACAATGCCCCTGTCACTCCCCAGGCCAGTCCGGAGCCGGGTGGCCCCGACCTATTGCGGACACCCCTC 222
Query 223 TACTCCCACTCGCCCCTGCTGCAGCCGCTGCCGCCCAGCAAGGCGGCCGAGGAGCTCCACCGGGTGGACTTGGT 296
|||||||||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||..|.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 TACTCCCACTCTCCCCTGCTCCAGCCACTGTCCCCGAGCAAGGCCACAGAGGAACTGCACCGGGTGGACTTCGT 296
Query 297 GCTGCCCGAGGACACCACCGAGTATTTCGTGCGCACCAAGGCCGGCGGCGTCTGCTTCAAACCCGGCACCAAGA 370
|.||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||.||
Sbjct 297 GTTGCCGGAGGACACCACGGAGTATTTTGTGCGCACCAAAGCTGGTGGTGTGTGCTTCAAACCAGGTACCAGGA 370
Query 371 TGCTGGAGAGGCCGCCCCCGGGACGGCCGGAGGAGAAGCCTGAGGGGGCCAACGGCTCCTCGGCCCGGCGGCCA 444
|||||||||..||..|.||.||.|||.|.|||||||||||.||.|.|.|..|.||||||||.||||||.|.||.
Sbjct 371 TGCTGGAGAAACCTTCGCCAGGGCGGACAGAGGAGAAGCCCGAAGTGTCTGAGGGCTCCTCAGCCCGGGGACCT 444
Query 445 CCCC------------GGTACCTCCTGAGCGCCCGGGAGCGCACGGGGGGCCGAGGCGCCCGGCGCAAGTGGGT 506
.|.| ||.||.|..||||..|.|||||||||..|||..||||.|||.|..|||||||||||||
Sbjct 445 GCTCGGAGGCCCATGAGGCACGTGTTGAGTACGCGGGAGCGCCTGGGCAGCCGGGGCACTAGGCGCAAGTGGGT 518
Query 507 GGAGTGCGTGTGCCTGCCCGGCTGGCACGGACCCAGCTGCGGCGTGCCCACTGTGGTGCAGTACTCCAACCTGC 580
.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 TGAGTGTGTGTGCCTGCCAGGCTGGCACGGGCCCAGTTGCGGGGTGCCCACGGTGGTGCAGTATTCCAACCTGC 592
Query 581 CCACCAAGGAGCGGCTGGTGCCCAGGGAGGTGCCGCGCCGCGTCATCAACGCCATCAACGTCAACCACGAGTTC 654
||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 593 CCACCAAGGAACGCCTGGTACCCAGGGAGGTACCGAGGCGGGTTATCAACGCCATCAACATCAACCACGAGTTC 666
Query 655 GACCTGCTGGACGTGCGCTTCCACGAGCTGGGCGACGTGGTGGACGCCTTTGTGGTGTGCGAGTCCAACTTCAC 728
|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 667 GACCTGCTGGATGTGCGTTTCCATGAGCTGGGAGATGTTGTGGACGCCTTCGTGGTCTGTGAATCTAATTTCAC 740
Query 729 GGCTTATGGGGAGCCGCGGCCGCTCAAGTTCCGGGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCACA 802
.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGCCTACGGGGAGCCTCGGCCGCTCAAGTTCCGAGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCACA 814
Query 803 AGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCACTTCCCGCCCGGCGGCCGGCAGGACGGCTGGATCGCCGACGACTACCTG 876
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 815 AGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCATTTCCCACCTGGTGGCCGTCAGGACGGCTGGATTGCGGATGACTACCTG 888
Query 877 CGCACCTTCCTCACCCAGGACGGCGTCTCGCGGCTGCGCAACCTGCGGCCCGACGACGTCTTCATCATTGACGA 950
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 889 CGCACCTTCCTCACCCAGGATGGCGTCTCCCGCCTGCGCAACCTGCGGCCCGATGACGTCTTTATCATCGACGA 962
Query 951 TGCGGACGAGATCCCGGCCCGTGACGGCGTCCTTTTCCTCAAGCTCTACGATGGCTGGACCGAGCCCTTCGCCT 1024
|||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 TGCGGACGAGATCCCTGCGCGTGATGGTGTGCTGTTCCTCAAACTCTACGATGGCTGGACAGAGCCCTTCGCCT 1036
Query 1025 TCCACATGCGCAAGTCGCTCTACGGCTTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACCCTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACG 1098
||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TCCACATGCGGAAGTCCCTGTATGGTTTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACACTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACC 1110
Query 1099 GTGGACATGCTGCAGGCAGTGTATGGGCTGGACGGCATCCGCCTGCGCCGCCGCCAGTACTACACCATGCCCAA 1172
.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGGACATGCTGCAGGCCGTGTATGGGCTGGATGGCATCCGCCTGCGCCGCCGCCAGTACTACACCATGCCCAA 1184
Query 1173 CTTCAGACAGTATGAGAACCGCACCGGCCACATCCTGGTGCAGTGGTCGCTGGGCAGCCCCCTGCACTTCGCCG 1246
||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 CTTCCGGCAGTATGAGAACCGCACCGGCCACATCCTAGTGCAGTGGTCTCTCGGCAGCCCCCTGCACTTCGCGG 1258
Query 1247 GCTGGCACTGCTCCTGGTGCTTCACGCCCGAGGGCATCTACTTCAAGCTCGTGTCCGCCCAGAATGGCGACTTC 1320
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCTGGCATTGCTCCTGGTGCTTCACACCCGAGGGCATCTACTTTAAACTCGTGTCAGCCCAGAATGGCGACTTC 1332
Query 1321 CCACGCTGGGGTGACTACGAGGACAAGCGGGACCTGAACTACATCCGCGGCCTGATCCGCACCGGGGGCTGGTT 1394
||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333 CCCCGCTGGGGTGACTATGAGGACAAGAGGGACCTCAATTACATCCGCAGCTTGATCCGCACTGGGGGATGGTT 1406
Query 1395 CGACGGCACGCAGCAGGAGTACCCGCCTGCAGACCCCAGCGAGCACATGTATGCGCCCAAGTACCTGCTGAAGA 1468
||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 1407 CGACGGAACGCAGCAGGAGTACCCTCCTGCGGACCCCAGTGAGCACATGTATGCTCCTAAATACCTGCTCAAGA 1480
Query 1469 ACTACGACCGGTTCCACTACCTGCTGGACAACCCCTACCAGGAGCCCAGGAGCACGGCGGCGGGCGGGTGGCGC 1542
||||.||||.|||||.||||.|||||||.||.|||||||.||||||||.||||||.|..|.|||.|||.|.||.
Sbjct 1481 ACTATGACCAGTTCCGCTACTTGCTGGAAAATCCCTACCGGGAGCCCAAGAGCACTGAAGAGGGTGGGCGCCGG 1554
Query 1543 CA-CAGGGGTCCCGAGGGAAGGCCGCCCGC---CCGGGGCAAACTGGACGAGGCGGAAGTC 1599
.| |||||.| |.||.||||||||..|.|| |.|||||||..||||....|.|||.|.|
Sbjct 1555 AACCAGGGCT-CAGATGGAAGGCCATCTGCTGTCAGGGGCAAGTTGGATACAGTGGAGGGC 1614