Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01062
• Subject: NM_001190796.3
• Aligned Length: 1135
• Identities: 925
• Gaps: 200

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGAAGTGGTGGTAGTAGCCAAATTTGATTATGTGGCCCAACAAGAACAAGAGTTGGACATCAAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATGAGAGATTATGGCTTCTGGATGATTCTAAGTCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGTGCCTTCTAACTATGTGGAAAGGAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATTGTGAAAAAC----CTAAAGGA  218
                                                          ||..|||| |..||||    .|||| ||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGATTG-GTTAAACGTCTTTAAA-GA  26

Query  219  TACCTTAGGCATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCTAGTGTGCCAGATTCTGCATCTCCTGCTGATGATAGTTTTG  292
            |...||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  TTTTTTCAGCATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCTAGTGTGCCAGATTCTGCATCTCCTGCTGATGATAGTTTTG  100

Query  293  TTGACCCAGGGGAACGTCTCTATGACCTCAACATGCCCGCTTATGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAG  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  TTGACCCAGGGGAACGTCTCTATGACCTCAACATGCCCGCTTATGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAG  174

Query  367  GATGAATTATCATTGATAAAGGGGACAAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGGTGGTGGCGTGGTAG  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  GATGAATTATCATTGATAAAGGGGACAAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGGTGGTGGCGTGGTAG  248

Query  441  CTACAATGGACAAGTTGGATGGTTCCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGACCATG  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CTACAATGGACAAGTTGGATGGTTCCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGACCATG  322

Query  515  TGGGTTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTCGTCAATAACCTAAATACTGGGCAAGTGTTGCATGTGGTACAG  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  TGGGTTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTCGTCAATAACCTAAATACTGGGCAAGTGTTGCATGTGGTACAG  396

Query  589  GCTCTTTACCCATTCAGCTCATCTAATGATGAAGAACTTAATTTCGAGAAAGGAGATGTAATGGATGTTATTGA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  GCTCTTTACCCATTCAGCTCATCTAATGATGAAGAACTTAATTTCGAGAAAGGAGATGTAATGGATGTTATTGA  470

Query  663  AAAACCTGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAGATCAATGGTATGGTTGGTCTAGTACCAAAAAACT  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  AAAACCTGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAGATCAATGGTATGGTTGGTCTAGTACCAAAAAACT  544

Query  737  ATGTTACCGTTATGCAGAATAATCCATTAACTTCAGGTTTGGAACCATCACCTCCACAGTGTGATTACATTAGG  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  ATGTTACCGTTATGCAGAATAATCCATTAACTTCAGGTTTGGAACCATCACCTCCACAGTGTGATTACATTAGG  618

Query  811  CCTTCACTCACTGGAAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCATCAAGCAGAAATGGC  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  CCTTCACTCACTGGAAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCATCAAGCAGAAATGGC  692

Query  885  ATTAAATGAAAGAGGACATGAAGGGGATTTCCTCATTCGTGATAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTAT  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  ATTAAATGAAAGAGGACATGAAGGGGATTTCCTCATTCGTGATAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTAT  766

Query  959  CACTAAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAACTAAAAGAGACTGTCTACTGCATTGGGCAGCGT  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  CACTAAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAACTAAAAGAGACTGTCTACTGCATTGGGCAGCGT  840

Query 1033  AAATTCAGCACCATGGAAGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCAATTTTTACAAGTGAACAAGGAGAAAA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  AAATTCAGCACCATGGAAGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCAATTTTTACAAGTGAACAAGGAGAAAA  914

Query 1107  ATTATATCTTGTCAAGCATTTATCA  1131
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  ATTATATCTTGTCAAGCATTTATCA  939