Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01062
• Subject: NM_001324530.1
• Aligned Length: 1134
• Identities: 862
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGAAGTGGTGGTAGTAGCCAAATTTGATTATGTGGCCCAACAAGAACAAGAGTTGGACATCAAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAATGAGAGATTATGGCTTCTGGATGATTCTAAGTCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGTGCCTTCTAACTATGTGGAAAGGAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATT-GTGAAAAACC--TAAAGGAT  219
                                                          ||..||| ||.|||.|.|  |||| |||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGATTGGTTAAACATCTTTAAA-GAT  27

Query  220  ACCTTAGGCATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCTAGTGTGCCAGATTCTGCATCTCCTGCTGATGATAGTTTTGT  293
            ...||..|.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   28  TTTTTCAGTATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCCAGTGTTCCAGATACTGCATCTCCTGCTGATGATAGCTTTGT  101

Query  294  TGACCCAGGGGAACGTCTCTATGACCTCAACATGCCCGCTTATGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGG  367
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  TGATCCAGGAGAACGTCTCTATGACCTTAACATGCCTGCTTTTGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGG  175

Query  368  ATGAATTATCATTGATAAAGGGGACAAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGGTGGTGGCGTGGTAGC  441
            ||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  176  ATGAGTTGTCATTGATAAAAGGGACCAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGATGGTGGCGTGGCAGC  249

Query  442  TACAATGGACAAGTTGGATGGTTCCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGACCATGT  515
            |||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  250  TACAACGGACAAATTGGATGGTTTCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGATCATGT  323

Query  516  GGGTTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTCGTCAATAACCTAAATACTGGGCAAGTGTTGCATGTGGTACAGG  589
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  324  AGGTTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTTGTCAATAACCTAAATACGGGTCAAGTATTGCATGTTGTACAGG  397

Query  590  CTCTTTACCCATTCAGCTCATCTAATGATGAAGAACTTAATTTCGAGAAAGGAGATGTAATGGATGTTATTGAA  663
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  398  CTCTTTACCCGTTTAGCTCATCCAATGATGAAGAACTCAATTTTGAGAAAGGCGATGTAATGGATGTTATTGAA  471

Query  664  AAACCTGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAGATCAATGGTATGGTTGGTCTAGTACCAAAAAACTA  737
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  472  AAGCCGGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAAATCAATGGCATGGTTGGCCTGGTGCCAAAAAACTA  545

Query  738  TGTTACCGTTATGCAGAATAATCCATTAACTTCAGGTTTGGAACCATCACCTCCACAGTGTGATTACATTAGGC  811
            .||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  546  CGTTACCATTATGCAAAACAATCCATTAACCTCAGGTTTGGAACCATCTCCTCCACAATGTGATTACATTAGGC  619

Query  812  CTTCACTCACTGGAAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCATCAAGCAGAAATGGCA  885
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  620  CTTCACTCACTGGGAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCACCAGGCAGAAATGGCA  693

Query  886  TTAAATGAAAGAGGACATGAAGGGGATTTCCTCATTCGTGATAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATC  959
            ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  TTAAATGAAAGAGGGCATGAAGGAGACTTCCTCATTCGTGACAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATC  767

Query  960  ACTAAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAACTAAAAGAGACTGTCTACTGCATTGGGCAGCGTA  1033
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  768  ACTAAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAGCTGAAAGAGACTGTTTACTGCATTGGGCAGCGGA  841

Query 1034  AATTCAGCACCATGGAAGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCAATTTTTACAAGTGAACAAGGAGAAAAA  1107
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  842  AATTCAGCACCATGGAGGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCGATCTTTACAAGTGAGCAAGGAGAAAAA  915

Query 1108  TTATATCTTGTCAAGCATTTATCA  1131
            ||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  916  TTATATCTCGTCAAGCATTTGTCT  939