Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01062
- Subject:
- NM_010878.3
- Aligned Length:
- 1131
- Identities:
- 1050
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCAGAAGAAGTGGTGGTAGTAGCCAAATTTGATTATGTGGCCCAACAAGAACAAGAGTTGGACATCAAGAA 74
|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGAAGAAGTGGTGGTGGTGGCCAAATTTGATTATGTGGCACAGCAGGAACAAGAGCTGGATATCAAGAA 74
Query 75 GAATGAGAGATTATGGCTTCTGGATGATTCTAAGTCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT 148
|||||||.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAATGAGCGATTATGGCTCCTGGATGACTCTAAATCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT 148
Query 149 TTGTGCCTTCTAACTATGTGGAAAGGAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATTGTGAAAAACCTAAAGGATACC 222
||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 TTGTCCCTTCTAACTATGTGGAAAGAAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATTGTTAAAAACCTGAAGGACACC 222
Query 223 TTAGGCATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCTAGTGTGCCAGATTCTGCATCTCCTGCTGATGATAGTTTTGTTGA 296
|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TTAGGTATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCCAGTGTTCCAGATACTGCATCTCCTGCTGATGATAGCTTTGTTGA 296
Query 297 CCCAGGGGAACGTCTCTATGACCTCAACATGCCCGCTTATGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGGATG 370
.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCAGGAGAACGTCTCTATGACCTTAACATGCCTGCTTTTGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGGATG 370
Query 371 AATTATCATTGATAAAGGGGACAAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGGTGGTGGCGTGGTAGCTAC 444
|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 AGTTGTCATTGATAAAAGGGACCAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGATGGTGGCGTGGCAGCTAC 444
Query 445 AATGGACAAGTTGGATGGTTCCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGACCATGTGGG 518
||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 445 AACGGACAAATTGGATGGTTTCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGATCATGTAGG 518
Query 519 TTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTCGTCAATAACCTAAATACTGGGCAAGTGTTGCATGTGGTACAGGCTC 592
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 TTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTTGTCAATAACCTAAATACGGGTCAAGTATTGCATGTTGTACAGGCTC 592
Query 593 TTTACCCATTCAGCTCATCTAATGATGAAGAACTTAATTTCGAGAAAGGAGATGTAATGGATGTTATTGAAAAA 666
|||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 TTTACCCGTTTAGCTCATCCAATGATGAAGAACTCAATTTTGAGAAAGGCGATGTAATGGATGTTATTGAAAAG 666
Query 667 CCTGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAGATCAATGGTATGGTTGGTCTAGTACCAAAAAACTATGT 740
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 667 CCGGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAAATCAATGGCATGGTTGGCCTGGTGCCAAAAAACTACGT 740
Query 741 TACCGTTATGCAGAATAATCCATTAACTTCAGGTTTGGAACCATCACCTCCACAGTGTGATTACATTAGGCCTT 814
||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 TACCATTATGCAAAACAATCCATTAACCTCAGGTTTGGAACCATCTCCTCCACAATGTGATTACATTAGGCCTT 814
Query 815 CACTCACTGGAAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCATCAAGCAGAAATGGCATTA 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 815 CACTCACTGGGAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCACCAGGCAGAAATGGCATTA 888
Query 889 AATGAAAGAGGACATGAAGGGGATTTCCTCATTCGTGATAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATCACT 962
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGAAAGAGGGCATGAAGGAGACTTCCTCATTCGTGACAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATCACT 962
Query 963 AAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAACTAAAAGAGACTGTCTACTGCATTGGGCAGCGTAAAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 AAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAGCTGAAAGAGACTGTTTACTGCATTGGGCAGCGGAAAT 1036
Query 1037 TCAGCACCATGGAAGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCAATTTTTACAAGTGAACAAGGAGAAAAATTA 1110
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAGCACCATGGAGGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCGATCTTTACAAGTGAGCAAGGAGAAAAATTA 1110
Query 1111 TATCTTGTCAAGCATTTATCA 1131
|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1111 TATCTCGTCAAGCATTTGTCT 1131