Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01107
• Subject: NM_001252260.1
• Aligned Length: 882
• Identities: 688
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC  74
           ||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||                 
Sbjct   1  ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTC-----------------  57

Query  75  CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG  148
                                 |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  58  ----------------------GTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG  109

Query 149  GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222
           |.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 110  GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  183

Query 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 184  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT  257

Query 297  CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG  370
           ||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 258  CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG  331

Query 371  AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT  444
           ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 332  AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT  405

Query 445  AGCAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA  515
           |.|||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||   |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 406  AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA  473

Query 516  TGATGAAGATGATGATGATGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAA-------  582
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..||||||||||||       
Sbjct 474  TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC  547

Query 583  --------------------------------------------------------------------------  582
                                                                                     
Sbjct 548  GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAACCATCAACACCGAGATCA  621

Query 583  ---GGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGACAT  653
              ||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622  AAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGACAT  695

Query 654  TAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATTATG  727
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 696  TAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATTATG  769

Query 728  TGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT  795
           ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 770  TGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT  837