Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01107
• Subject: NM_008722.3
• Aligned Length: 882
• Identities: 723
• Gaps: 93

Alignment

Query   1  ATGGAAGATTCGATGGACATGGACATGAGCCCCCTGAGGCCCCAGAACTATCTTTTCGGTTGTGAACTAAAGGC  74
           ||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAAGACTCGATGGATATGGACATGAGTCCTCTTAGGCCTCAGAACTACCTTTTCGGCTGTGAACTAAAGGC  74

Query  75  CGACAAAGATTATCACTTTAAGGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTATCTTTAAGAACGGTCAGTTTAG  148
           .||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGACAAAGACTATCACTTTAAAGTGGATAATGATGAAAATGAGCACCAGTTGTCATTAAGAACGGTCAGTTTAG  148

Query 149  GGGCTGGTGCAAAGGATGAGTTGCACATTGTTGAAGCAGAGGCAATGAATTACGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222
           |.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GAGCAGGGGCAAAAGATGAGTTACACATCGTAGAGGCAGAAGCAATGAACTATGAAGGCAGTCCAATTAAAGTA  222

Query 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAGCCAACGGTTTCCCTTGGGGGCTTTGAAATAACACCACCAGTGGT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 223  ACACTGGCAACTTTGAAAATGTCTGTACAACCAACAGTTTCCCTAGGGGGCTTTGAAATTACACCACCTGTGGT  296

Query 297  CTTAAGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCAGTGCATATTAGTGGACAGCACTTAGTAGCTGTGGAGGAAGATGCAG  370
           ||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297  CTTACGGTTGAAGTGTGGTTCAGGGCCTGTGCACATTAGTGGACAGCATCTAGTAGCTGTAGAGGAAGATGCAG  370

Query 371  AGTCAGAAGATGAAGAGGAGGAGGATGTGAAACTCTTAAGTATATCTGGAAAGCGGTCTGCCCCTGGAGGTGGT  444
           ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 371  AGTCTGAAGATGAAGATGAGGAGGACGTAAAACTCTTAGGCATGTCTGGAAAGCGATCTGCTCCTGGAGGTGGT  444

Query 445  AGCAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACTTGCTGCTGATGAAGATGAT---GACGATGATGATGAAGAGGATGA  515
           |.|||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||   |||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 445  AACAAGGTTCCACAGAAAAAAGTAAAACT------TGATGAAGATGATGAGGACGATGATGAGGACGATGAGGA  512

Query 516  TGATGAAGATGATGATGATGATGATTTTGATGATGAGGAAGCTGAAGAAAAAGCGCCAGTGAAGAAA-------  582
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|..||||||||||||       
Sbjct 513  TGATGAGGATGATGATGATGATGATTTTGATGAAGAGGAAACTGAAGAAAAGGTCCCAGTGAAGAAATCTGTAC  586

Query 583  --------------------------------------------------------------------------  582
                                                                                     
Sbjct 587  GAGATACCCCAGCCAAAAATGCACAAAAATCAAACCAAAATGGAAAAGACTTAAAACCATCAACACCGAGATCA  660

Query 583  ---GGACAAGAATCCTTCAAGAAACAGGAAAAAACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGACAT  653
              ||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661  AAGGGTCAAGAGTCCTTCAAAAAACAGGAAAAGACTCCTAAAACACCAAAAGGACCTAGTTCTGTAGAAGACAT  734

Query 654  TAAAGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGTGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAATTCATCAATTATG  727
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 735  TAAGGCAAAAATGCAAGCAAGTATAGAAAAAGGCGGTTCTCTTCCCAAAGTGGAAGCCAAGTTCATTAATTATG  808

Query 728  TGAAGAATTGCTTCCGGATGACTGACCAAGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAGTCTCTT  795
           ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 809  TGAAGAATTGTTTCCGGATGACTGACCAGGAGGCTATTCAAGATCTCTGGCAGTGGAGGAAATCTCTT  876