Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01163
• Subject: NM_001173456.1
• Aligned Length: 1170
• Identities: 1077
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGAGGAAGATGCTCGCCGCCGTCTCCCGCGTGCTGTCTGGCGCTTCTCAGAAGCCGGCAAGCAGAGTGCTGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAAGATGCTCGCCGCCGTCTCCCGCGTGCTGTCTGGCGCTTCTCAGAAGCCGGCAAGCAGAGTGCTGGT  74

Query   75  AGCATCCCGTAATTTTGCAAATGATGCTACATTTGAAATTAAGAAATGTGACCTTCACCGGCTGGAAGAAGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCATCCCGTAATTTTGCAAATGATGCTACATTTGAAATTAAGAAATGTGACCTTCACCGGCTGGAAGAAGGCC  148

Query  149  CTCCTGTCACAACAGTGCTCACCAGGGAGGATGGGCTCAAATACTACAGGATGATGCAGACTGTACGCCGAATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCTGTCACAACAGTGCTCACCAGGGAGGATGGGCTCAAATACTACAGGATGATGCAGACTGTACGCCGAATG  222

Query  223  GAGTTGAAAGCAGATCAGCTGTATAAACAGAAAATTATTCGTGGTTTCTGTCACTTGTGTGATGGTCAGGAAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTTGAAAGCAGATCAGCTGTATAAACAGAAAATTATTCGTGGTTTCTGTCACTTGTGTGATGGTCAGGAAGC  296

Query  297  TTGCTGTGTGGGCCTGGAGGCCGGCATCAACCCCACAGACCATCTCATCACAGCCTACCGGGCTCACGGCTTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGCTGTGTGGGCCTGGAGGCCGGCATCAACCCCACAGACCATCTCATCACAGCCTACCGGGCTCACGGCTTTA  370

Query  371  CTTTCACCCGGGGCCTTTCCGTCCGAGAAATTCTCGCAGAGCTTACAGGACGAAAAGGAGGTTGTGCTAAAGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTCACCCGGGGCCTTTCCGTCCGAGAAATTCTCGCAGAGCTTACAGGACGAAAAGGAGGTTGTGCTAAAGGG  444

Query  445  AAAGGAGGATCGATGCACATGTATGCCAAGAACTTCTACGGGGGCAATGGCATCGTGGGAGCGCAGGTGCCCCT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  445  AAAGGAGGATCGATGCACATGTATGCCAAGAACTTCTACGGGGGCAATGGCATCGTGGGAGCG-----------  507

Query  519  GGGCGCTGGGATTGCTCTAGCCTGTAAGTATAATGGAAAAGATGAGGTCTGCCTGACTTTATATGGCGATGGTG  592
                                                                                      
Sbjct  508  --------------------------------------------------------------------------  507

Query  593  CTGCTAACCAGGGCCAGATATTCGAAGCTTACAACATGGCAGCTTTGTGGAAATTACCTTGTATTTTCATCTGT  666
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  --------CAGGGCCAGATATTCGAAGCTTACAACATGGCAGCTTTGTGGAAATTACCTTGTATTTTCATCTGT  573

Query  667  GAGAATAATCGCTATGGAATGGGAACGTCTGTTGAGAGAGCGGCAGCCAGCACTGATTACTACAAGAGAGGCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GAGAATAATCGCTATGGAATGGGAACGTCTGTTGAGAGAGCGGCAGCCAGCACTGATTACTACAAGAGAGGCGA  647

Query  741  TTTCATTCCTGGGCTGAGAGTGGATGGAATGGATATCCTGTGCGTCCGAGAGGCAACAAGGTTTGCTGCTGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  TTTCATTCCTGGGCTGAGAGTGGATGGAATGGATATCCTGTGCGTCCGAGAGGCAACAAGGTTTGCTGCTGCCT  721

Query  815  ATTGTAGATCTGGGAAGGGGCCCATCCTGATGGAGCTGCAGACTTACCGTTACCACGGACACAGTATGAGTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  ATTGTAGATCTGGGAAGGGGCCCATCCTGATGGAGCTGCAGACTTACCGTTACCACGGACACAGTATGAGTGAC  795

Query  889  CCTGGAGTCAGTTACCGTACACGAGAAGAAATTCAGGAAGTAAGAAGTAAGAGTGACCCTATTATGCTTCTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  CCTGGAGTCAGTTACCGTACACGAGAAGAAATTCAGGAAGTAAGAAGTAAGAGTGACCCTATTATGCTTCTCAA  869

Query  963  GGACAGGATGGTGAACAGCAATCTTGCCAGTGTGGAAGAACTAAAGGAAATTGATGTGGAAGTGAGGAAGGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GGACAGGATGGTGAACAGCAATCTTGCCAGTGTGGAAGAACTAAAGGAAATTGATGTGGAAGTGAGGAAGGAGA  943

Query 1037  TTGAGGATGCTGCCCAGTTTGCCACGGCCGATCCTGAGCCACCTTTGGAAGAGCTGGGCTACCACATCTACTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  TTGAGGATGCTGCCCAGTTTGCCACGGCCGATCCTGAGCCACCTTTGGAAGAGCTGGGCTACCACATCTACTCC  1017

Query 1111  AGCGACCCACCTTTTGAAGTTCGTGGTGCCAATCAGTGGATCAAGTTTAAGTCAGTCAGT  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  AGCGACCCACCTTTTGAAGTTCGTGGTGCCAATCAGTGGATCAAGTTTAAGTCAGTCAGT  1077