Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01168
• Subject: XM_017023275.2
• Aligned Length: 1448
• Identities: 1240
• Gaps: 190

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATG-GCC--AGGAC  11
                                                                        .|| |||  |||||
Sbjct    1  ATGTTGAAGATGTGGGTTAGTGAAATTGAGACCTGGCGCTTCCTGAGGCTGGCAGCCCGGTTGAGCCTGAGGAC  74

Query   12  CA---------------CCAGCCAGC------------------------TGTATGACGCCGTGCCCATCCAGT  46
            ||               .|||.|.||                        .|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGACTTGAGGCAGTTGGCAGTCCGCGCCTCGTTGCCCTCTGTCTGCCCTGGTATGACGCCGTGCCCATCCAGT  148

Query   47  CCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATCCCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATCCCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGC  222

Query  121  ATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCGCCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCGCCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCT  296

Query  195  GCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCTCGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGG  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCTCGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGG  370

Query  269  AAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGCTCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGACCAGGGCCAACTCA  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGCTCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGACCAGGGCCAACTCA  444

Query  343  TTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTG  518

Query  417  GGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATAT  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATAT  592

Query  491  TTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAA  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAA  666

Query  565  CTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCC  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCC  740

Query  639  GTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTA  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTA  814

Query  713  TGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCT  888

Query  787  TCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCA  962

Query  861  GTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGT  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGT  1036

Query  935  TGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTG  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTG  1110

Query 1009  GATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGA  1184

Query 1083  TCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAA  1258

Query 1157  CTTTCTTTGTCCACACG-----------CCTAACAGGACGTATTATCTG-----------ATGG----------  1198
            |||||||||||||||||           ||   |||   |.||| ||||           ||||          
Sbjct 1259  CTTTCTTTGTCCACACGGTGAGTCTGTTCC---CAG---GGATT-TCTGTGTGCAGGGTAATGGGAGGGCTTTG  1325

Query 1199  -ACCCCAGCGGGAACGCA--CACAAG---TGGTGC---AGGAAGATCCAG-GAGGTTTGGAGGCAGC-------  1255
             |||.| |.||||| |||  ||||.|   ||  ||   |||.||   ||| |.||.|.|| ||||||       
Sbjct 1326  CACCAC-GTGGGAA-GCAGCCACAGGCCTTG--GCCAGAGGGAG---CAGCGGGGATCGG-GGCAGCTGCCTCG  1391

Query 1256  ----------GATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG  1287
                      .||.|||||  |.|||..||            
Sbjct 1392  CCCTTTCCGACATCCCAGA--CGCCCACAC------------  1419