Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01279
- Subject:
- NM_001206709.2
- Aligned Length:
- 1020
- Identities:
- 993
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA 74
Query 75 CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG 148
Query 149 TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA 222
Query 223 TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTG---------------------------GGCATGCTGACCATCACTGA 269
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGTGCTGAGGGCTCTGTCTTGTCCTCTAGGCATGCTGACCATCACTGA 296
Query 270 TTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTATAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTATAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAG 370
Query 344 AAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTT 444
Query 418 GATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACAAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTT 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACAAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTT 518
Query 492 GTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTGAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCA 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTGAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCA 592
Query 566 TGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGATTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTC 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGATTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTC 666
Query 640 TATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGCATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGT 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGCATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGT 740
Query 714 GGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATCAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGA 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATCAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGA 814
Query 788 CTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACC 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACC 888
Query 862 ATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGGTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAAT 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGGTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAAT 962
Query 936 TGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCCCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCCCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC 1020