Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01283
• Subject: NM_011104.3
• Aligned Length: 2216
• Identities: 2018
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCGGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74

Query   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCACAGACGTTCCTTTTGGACCCCTACATTGCCCTTAACGTGGACGACTCGC  148

Query  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGGCCAAACAGCCACCAAGCAAAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGATGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222

Query  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGGGCGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGACGCTCCTATCGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296

Query  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCCAGTTCGAGGAGCTGCTGCAGAATGGGAGCCGTCACTTCGAGGACTGGATTGACCTGGAGCCAGAAGGAA  370

Query  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG  444
            .||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAGTGTACGTGATCATCGATCTCTCGGGATCATCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAACGAGTGTTCAGG  444

Query  445  GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT  518
            ||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCGTATGCGGCCAAGGAAGCGGCAAGGGGCTGTCAGGCGCAGGGTCCACCAGGTCAATGGCCACAAGTTCAT  518

Query  519  GGCCACCTATCTT-CGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAG  591
            ||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  519  GGCCACCTA-CTTGCGGCAACCCACCTACTGCTCCCACTGCAGAGATTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAACAG  591

Query  592  GGATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGG  665
            |||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  592  GGATATCAATGTCAAGTTTGCACTTGCGTTGTCCACAAGCGATGTCATGAGCTCATTATTACAAAGTGCGCTGG  665

Query  666  GTTAAAGAAGCAGGAGACCCCCGACCAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGGTA  739
            |.|.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  666  GCTGAAGAAACAGGAAACCCCTGACGAGGTGGGCTCCCAACGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGGGA  739

Query  740  TCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTTG  813
            |||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  740  TCCACAACTACAAGGTCCCCACGTTCTGTGACCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGCCTCTTGCGGCAGGGCTTG  813

Query  814  CAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATGC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  814  CAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGGCGATGTGAGACCAATGTGGCTCCCAACTGTGGGGTAGACGC  887

Query  888  CAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGGA  961
            |||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  888  CAGAGGAATTGCCAAAGTGCTGGCTGACCTTGGTGTTACTCCAGACAAAATCACCAACAGTGGCCAAAGGAGGA  961

Query  962  AAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAAG  1035
            ||||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  962  AAAAGCTCGCTGCTGGTGCTGAGTCCCCACAGCCGGCTTCTGGAAACTCCCCATCTGAAGACGACCGATCCAAG  1035

Query 1036  TCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTGA  1109
            |||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036  TCAGCGCCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAACTAAAAGAACTTGAAAACAACATTCGGAAGGCCTTGTCATTTGA  1109

Query 1110  CAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGT----CTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGC  1179
            |||||||||||||||||||||   |||.||||    |.|| ||||||||||||...||||||||.|||||.||.
Sbjct 1110  CAACCGAGGAGAGGAGCACCG---AGCGTCGTCGGCCACC-GATGGCCAGCTGGCAAGCCCCGGAGAGAACGGG  1179

Query 1180  GAAGTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAG  1253
            ||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  GAAGTCCGGCCAGGCCAGGCCAAGCGCTTGGGGCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAG  1253

Query 1254  CTTTGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACG  1327
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1254  CTTTGGCAAGGTCATGTTGGCGGAACTCAAAGGCAAAGATGAAGTCTACGCTGTGAAGGTCTTGAAGAAGGACG  1327

Query 1328  TCATCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCG  1401
            |.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1328  TTATCCTACAAGACGATGATGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCTCGGAAACACCCT  1401

Query 1402  TACCTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGG  1475
            ||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  TATCTAACCCAACTCTATTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTCTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGG  1475

Query 1476  AGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGGTTCTATGCTGCAGAGGTCA  1549
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1476  AGACCTCATGTTCCAGATTCAGCGGTCCCGAAAATTTGATGAGCCTCGTTCTCGGTTCTATGCCGCAGAGGTCA  1549

Query 1550  CATCGGCCCTCATGTTCCTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTGGAT  1623
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1550  CATCAGCCCTCATGTTTCTCCACCAGCACGGAGTGATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTAGAT  1623

Query 1624  GCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCACCAC  1697
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1624  GCAGAAGGCCACTGCAAGCTGGCTGACTTTGGGATGTGCAAGGAAGGGATTATGAATGGTGTGACAACTACCAC  1697

Query 1698  GTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGT  1771
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1698  CTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCAGAGATCCTACAGGAGTTGGAGTACGGCCCCTCAGTGGACTGGT  1771

Query 1772  GGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTA  1845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.
Sbjct 1772  GGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGGCAGCCCCCCTTTGAAGCTGACAACGAGGACGACTTG  1845

Query 1846  TTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGC  1919
            ||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1846  TTCGAATCCATCCTTCATGATGATGTTCTCTATCCTGTCTGGCTTAGCAAGGAAGCTGTCAGCATCCTGAAAGC  1919

Query 1920  TTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGCAGC  1993
            |||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1920  TTTCATGACCAAGAACCCGCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCAGCGCAGAACGGGGAGGACGCCATCAAGCAAC  1993

Query 1994  ACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGCATT  2067
            |.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|.|||
Sbjct 1994  ATCCATTCTTCAAGGAGATTGACTGGGTACTGCTGGAGCAGAAGAAAATCAAGCCCCCCTTCAAGCCGAGAATT  2067

Query 2068  AAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGACGA  2141
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||.||
Sbjct 2068  AAAACCAAAAGAGATGTCAATAACTTTGACCAAGACTTTACGCGGGAAGAGCCAATACTTACACTTGTGGATGA  2141

Query 2142  AGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2211
            ||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142  AGCAATCATTAAGCAGATCAACCAGGAAGAATTCAAAGGCTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2211