Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01300
• Subject: NM_001164244.1
• Aligned Length: 1107
• Identities: 767
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  ATGTTTTGTGTGACGCCACCTGAATTAGAAACCAAGATGAACATAACCAAAGGTGGTCTGGTGTTGTTTTCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTCGAATTCATCATGTATGGAGCTATCAAAGAAAATTGCAGAGCGGCTAGGGGTGGAGATGGGCAAAGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTTTACCAGGAACCTAACAGAGAAACAAGAGTACAAATTCAAGAGTCTGTGAGGGGAAAAGATGTTTTCATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATCCAAACTGTTTCGAAGGACGTGAACACCACCATCATGGAGCTCCTGATCATGGTGTATGCATGTAAGACCTC  296
                                                ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGGAGCTGCTGATCATGGTATATGCATGTAAGACCTC  38

Query  297  TTGTGCCAAGAGCATCATTGGCGTGATACCCTACTTTCCTTACAGCAAGCAGTGCAAGATGAGAAAAAGAGGCT  370
            .|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct   39  ATGTGCCAAGAGCATCATCGGAGTGATCCCCTACTTTCCTTATAGCAAGCAATGCAAAATGAGAAAAAGGGGCT  112

Query  371  CCATTGTCTCTAAATTGCTGGCTTCCATGATGTGCAAAGCTGGTCTAACTCATCTTATTACTATGGATTTACAC  444
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  113  CCATTGTCTCAAAATTGCTGGCTTCTATGATGTGCAAAGCTGGTCTGACTCATCTCATCACTATGGATTTACAC  186

Query  445  CAGAAGGAAATTCAGGGCTTCTTCAATATTCCTGTTGACAATTTAAGAGCATCTCCCTTCTTATTACAGTATAT  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.|||||.|||||
Sbjct  187  CAGAAGGAAATCCAGGGCTTCTTCAATATTCCAGTGGATAATTTAAGAGCCTCCCCATTCCTGTTACAATATAT  260

Query  519  TCAAGAAGAGATCCCAGATTACAGGAATGCAGTAATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCGGCGAAGAGGGCACAGT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  261  TCAAGAAGAGATCCCAGATTATAGGAATGCAGTCATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCAGCCAAGAGGGCACAAT  334

Query  593  CTTTTGCTGAGCGCCTGCGCCTGGGAATTGCAGTGATTCATGGAGAGGCGCAGGATGCCGAGTCGGACTTGGTG  666
            |||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  335  CTTTTGCAGAGCGTCTACGTCTGGGAATCGCAGTGATCCATGGAGAAGCACAGGATGCTGAGTCTGACTTGGTG  408

Query  667  GATGGACGGCATTCCCCACCCATGGTCAGAAGTGTGGCTGCCATCCACCCCAGCCTGGAGATCCCCATGCTGAT  740
            |||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  409  GATGGCCGGCACTCCCCACCAATGGTCAGGAGTGTAGCTGCCATCCATCCCAGCCTGGAGATCCCGATGCTGAT  482

Query  741  TCCTAAAGAAAAGCCCCCAATCACGGTTGTGGGTGATGTTGGAGGAAGGATTGCCATCATCGTGGATGACATCA  814
            |||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  483  TCCTAAAGAGAAGCCCCCAATCACAGTTGTTGGTGATGTTGGAGGAAGAATCGCCATCATTGTGGATGACATTA  556

Query  815  TTGATGATGTTGACAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATATAAGATCTTTGTGATG  888
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  557  TTGATGATGTGGATAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATACAAGATCTTTGTGATG  630

Query  889  GCAACTCATGGCTTGTTGTCTTCTGACGCCCCCCGGCGGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC  962
            ||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  GCCACTCACGGCTTGTTATCCTCTGATGCTCCCCGGCTGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC  704

Query  963  CAATACAATTCCACATGAAGTCCAGAAGCTCCAGTGCCCCAAGATTAAAACTGTGGATATCAGCATGATCCTTT  1036
            .||.||.||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  705  TAACACGATCCCACACGAGATCCAGAAGCTGCAGTGCCCCAAGATCAAGACTGTGGACATCAGCATGATCCTCT  778

Query 1037  CAGAGGCGATCCGTCGGATCCACAATGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC  1107
            ||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  CAGAAGCCATCCGCCGAATTCACAACGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC  849