Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01300
Subject:
XM_017314419.1
Aligned Length:
1107
Identities:
787
Gaps:
237

Alignment

Query    1  ATGTTTTGTGTGACGCCACCTGAATTAGAAACCAAGATGAACATAACCAAAGGTGGTCTGGTGTTGTTTTCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTCGAATTCATCATGTATGGAGCTATCAAAGAAAATTGCAGAGCGGCTAGGGGTGGAGATGGGCAAAGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTTTACCAGGAACCTAACAGAGAAACAAGAGTACAAATTCAAGAGTCTGTGAGGGGAAAAGATGTTTTCATC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATCCAAACTGTTTCGAAGGACGTGAACACCACCATCATGGAGCTCCTGATCATGGTGTATGCATGTAAGACCTC  296
                           |.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------ATGGACGTGAACACCACCATCATGGAGCTGCTGATCATGGTATATGCATGTAAGACCTC  59

Query  297  TTGTGCCAAGAGCATCATTGGCGTGATACCCTACTTTCCTTACAGCAAGCAGTGCAAGATGAGAAAAAGAGGCT  370
            .|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct   60  ATGTGCCAAGAGCATCATCGGAGTGATCCCCTACTTTCCTTATAGCAAGCAATGCAAAATGAGAAAAAGGGGCT  133

Query  371  CCATTGTCTCTAAATTGCTGGCTTCCATGATGTGCAAAGCTGGTCTAACTCATCTTATTACTATGGATTTACAC  444
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  134  CCATTGTCTCAAAATTGCTGGCTTCTATGATGTGCAAAGCTGGTCTGACTCATCTCATCACTATGGATTTACAC  207

Query  445  CAGAAGGAAATTCAGGGCTTCTTCAATATTCCTGTTGACAATTTAAGAGCATCTCCCTTCTTATTACAGTATAT  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.|||||.|||||
Sbjct  208  CAGAAGGAAATCCAGGGCTTCTTCAATATTCCAGTGGATAATTTAAGAGCCTCCCCATTCCTGTTACAATATAT  281

Query  519  TCAAGAAGAGATCCCAGATTACAGGAATGCAGTAATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCGGCGAAGAGGGCACAGT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  282  TCAAGAAGAGATCCCAGATTATAGGAATGCAGTCATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCAGCCAAGAGGGCACAAT  355

Query  593  CTTTTGCTGAGCGCCTGCGCCTGGGAATTGCAGTGATTCATGGAGAGGCGCAGGATGCCGAGTCGGACTTGGTG  666
            |||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  356  CTTTTGCAGAGCGTCTACGTCTGGGAATCGCAGTGATCCATGGAGAAGCACAGGATGCTGAGTCTGACTTGGTG  429

Query  667  GATGGACGGCATTCCCCACCCATGGTCAGAAGTGTGGCTGCCATCCACCCCAGCCTGGAGATCCCCATGCTGAT  740
            |||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  430  GATGGCCGGCACTCCCCACCAATGGTCAGGAGTGTAGCTGCCATCCATCCCAGCCTGGAGATCCCGATGCTGAT  503

Query  741  TCCTAAAGAAAAGCCCCCAATCACGGTTGTGGGTGATGTTGGAGGAAGGATTGCCATCATCGTGGATGACATCA  814
            |||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  504  TCCTAAAGAGAAGCCCCCAATCACAGTTGTTGGTGATGTTGGAGGAAGAATCGCCATCATTGTGGATGACATTA  577

Query  815  TTGATGATGTTGACAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATATAAGATCTTTGTGATG  888
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  578  TTGATGATGTGGATAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATACAAGATCTTTGTGATG  651

Query  889  GCAACTCATGGCTTGTTGTCTTCTGACGCCCCCCGGCGGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC  962
            ||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  GCCACTCACGGCTTGTTATCCTCTGATGCTCCCCGGCTGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC  725

Query  963  CAATACAATTCCACATGAAGTCCAGAAGCTCCAGTGCCCCAAGATTAAAACTGTGGATATCAGCATGATCCTTT  1036
            .||.||.||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  726  TAACACGATCCCACACGAGATCCAGAAGCTGCAGTGCCCCAAGATCAAGACTGTGGACATCAGCATGATCCTCT  799

Query 1037  CAGAGGCGATCCGTCGGATCCACAATGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC  1107
            ||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  CAGAAGCCATCCGCCGAATTCACAACGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC  870