Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01317
- Subject:
- NM_008950.1
- Aligned Length:
- 1218
- Identities:
- 1099
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGCTTGACGGACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT 74
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCTTGATGGGCCAGAGCAGATGGAACTGGAAGAGGGGAAGGCAGGCAGTGGACTCCGTCAATATTATCT 74
Query 75 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA 148
||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGTTGATTGTAAATGATAAGAGCCAGAATCTCCGTAGACTGCAGGCACAGAGGA 148
Query 149 ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG 222
|.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 149 ATGAGCTGAATGCAAAAGTTCGCCTGTTGCGGGAGGAGCTGCAGCTGTTGCAGGAACAGGGCTCCTACGTTGGA 222
Query 223 GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT 296
|||||.||..||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 223 GAAGTCGTGAGGGCCATGGATAAGAAAAAAGTATTGGTCAAGGTCCATCCTGAGGGCAAATTTGTTGTTGATGT 296
Query 297 GGACAAAAACATTGACATCAATGATGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTACACTCTGC 370
||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACAAGAACATTGATATCAACGATGTGACGCCCAATTGTCGGGTCGCTCTAAGAAATGACAGCTACACTCTGC 370
Query 371 ACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTCAACTTAT 444
|.||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 371 ATAAGATCTTACCTAACAAGGTGGACCCTTTGGTGTCACTAATGATGGTGGAGAAGGTGCCAGACTCAACCTAC 444
Query 445 GAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGCATCCTGA 518
|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 445 GAGATGATTGGCGGCCTGGACAAGCAGATCAAGGAGATTAAAGAAGTGATCGAGCTGCCCGTGAAGCACCCCGA 518
Query 519 GCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGGAAGACAC 592
||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 519 GCTCTTTGAAGCACTGGGCATCGCACAGCCAAAGGGAGTCCTGCTCTACGGACCCCCAGGCACTGGGAAGACAT 592
Query 593 TGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAA 666
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTTGGCCCGCGCTGTGGCTCATCATACAGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAA 666
Query 667 TTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTATCATCTT 740
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 TTCATCGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCCCGAGAACATGCTCCATCCATCATCTT 740
Query 741 CATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTGCAGCGCA 814
|||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 741 CATGGACGAGATTGACTCTATTGGCTCCTCACGGCTGGAGGGGGGCTCTGGAGGCGACAGTGAGGTACAGCGCA 814
Query 815 CGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGCTACTAAT 888
||||||||||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGATGCTGGAACTGCTCAATCAGCTGGATGGCTTTGAGGCCACCAAGAATATCAAGGTTATCATGGCTACTAAT 888
Query 889 AGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCCAA 962
||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGATTGATATCCTGGACTCTGCCCTGCTTCGTCCTGGGAGGATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCCAA 962
Query 963 TGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAACCTGAGAA 1036
.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 963 CGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAAATCCACTCTCGGAAAATGAACTTGACCAGGGGGATCAACCTGAGGA 1036
Query 1037 AAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTATGCC 1110
|||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 AAATTGCTGAGTTGATGCCGGGAGCTTCAGGGGCTGAAGTGAAGGGTGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTACGCC 1110
Query 1111 CTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGAAGGACAG 1184
|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 CTGCGGGAACGGCGTGTCCACGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCTAAGGTCATGCAAAAGGATAG 1184
Query 1185 TGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG 1218
||||||||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct 1185 TGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAGCTATGGAAG 1218