Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01317
• Subject: XM_024450840.1
• Aligned Length: 1299
• Identities: 1218
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGCGCTTGACGGACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTTGACGGACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT  74

Query   75  GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA  148

Query  149  ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG  222

Query  223  GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT  296

Query  297  GGACAAAAACATTGACATCAATGAT-------------------------------------------------  321
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  297  GGACAAAAACATTGACATCAATGATGTGAGTGTAGCAGGTGAGGTGGTGGTGGTGGTGGGGTCAGCTCTTACTG  370

Query  322  --------------------------------GTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTAC  363
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACCACTTCTGAAACTCGCCCCCTTCACCCAGGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTAC  444

Query  364  ACTCTGCACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTC  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCTGCACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTC  518

Query  438  AACTTATGAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGC  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTTATGAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGC  592

Query  512  ATCCTGAGCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGG  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCTGAGCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGG  666

Query  586  AAGACACTGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACACTGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGT  740

Query  660  ACAGAAATTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAAATTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTA  814

Query  734  TCATCTTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATCTTCATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTG  888

Query  808  CAGCGCACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCGCACGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGC  962

Query  882  TACTAATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCAC  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTAATAGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCAC  1036

Query  956  CCCCCAATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAAC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCCCAATGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAAC  1110

Query 1030  CTGAGAAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCAT  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAGAAAAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCAT  1184

Query 1104  GTATGCCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGA  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTATGCCCTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGA  1258

Query 1178  AGGACAGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG  1218
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGACAGTGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG  1299