Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01320
• Subject: NM_001282017.1
• Aligned Length: 1140
• Identities: 1020
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGTGTTGGAAAGCACTATGGTGTGTGTGGACAACAGTGAGTATATGCGGAATGGAGACTTCTTACCCACCAG  74
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||.|
Sbjct    1  ATGGTGTTGGAGAGCACTATGGTTTGTGTGGACAACAGTGAGTACATGCGGAACGGAGACTTCCTTCCCACCCG  74

Query   75  GCTGCAGGCCCAGCAGGATGCTGTCAACATAGTTTGTCATTCAAAGACCCGCAGCAACCCTGAGAACAACGTGG  148
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GCTGCAGGCCCAGCAGGATGCCGTCAACATTGTATGTCACTCAAAGACCCGAAGCAACCCTGAGAATAACGTGG  148

Query  149  GCCTTATCACACTGGCTAATGACTGTGAAGTGCTGACCACACTCACCCCAGACACTGGCCGTATCCTGTCCAAG  222
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GCCTGATCACACTGGCCAATGACTGTGAGGTGCTGACCACACTCACCCCGGACACTGGCCGTATCCTCTCCAAG  222

Query  223  CTACATACTGTCCAACCCAAGGGCAAGATCACCTTCTGCACGGGCATCCGCGTGGCCCATCTGGCTCTGAAGCA  296
            ||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  223  CTCCACACTGTCCAACCCAAAGGCAAGATCACCTTCTGCACTGGCATCCGCGTGGCCCACTTGGCTCTGAAGCA  296

Query  297  CCGACAAGGCAAGAATCACAAGATGCGCATCATTGCCTTTGTGGGAAGCCCAGTGGAGGACAATGAGAAGGATC  370
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CCGGCAGGGCAAGAATCACAAGATGCGCATCATCGCCTTTGTCGGTAGCCCTGTGGAGGACAACGAGAAGGATC  370

Query  371  TGGTGAAACTGGCTAAACGCCTCAAGAAGGAGAAAGTAAATGTTGACATTATCAATTTTGGGGAAGAGGAGGTG  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGAAACTAGCTAAACGCCTTAAGAAAGAAAAAGTGAATGTTGACATCATTAATTTTGGGGAAGAGGAGGTG  444

Query  445  AACACAGAAAAGCTGACAGCCTTTGTAAACACGTTGAATGGCAAAGATGGAACCGGTTCTCATCTGGTGACAGT  518
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  AACACAGAGAAGCTGACAGCCTTTGTGAACACACTGAATGGCAAGGATGGAACTGGGTCCCATCTAGTGACAGT  518

Query  519  GCCTCCTGGGCCCAGTTTGGCTGATGCTCTCATCAGTTCTCCGATTTTGGCTGGTGAAGGTGGTGCCATGCTGG  592
            |||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCCTCCTGGACCTAGCTTGGCTGATGCTCTCATCAGTTCTCCTATTCTGGCTGGTGAAGGCGGTGCCATGCTGG  592

Query  593  GTCTTGGTGCCAGTGACTTTGAATTTGGAGTAGATCCCAGTGCTGATCCTGAGCTGGCCTTGGCCCTTCGTGTA  666
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||.||.
Sbjct  593  GTCTTGGTGCCAGTGACTTTGAGTTTGGAGTAGATCCCAGTGCTGATCCTGAATTGGCCCTGGCCCTTCGAGTC  666

Query  667  TCTATGGAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGGAGGCCCGGCGGGCAGCTGCAGCTTCTGCTGCTGAGGCCGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  667  TCTATGGAAGAGCAGCGGCAGCGGCAGGAGGAAGAGGCACGGCGGGCCGCTGCGGCCTCTGCAGCTGAGGCTGG  740

Query  741  GATTGCTACGACTGGGACTGA---------AGACTCAGACGATGCCCTGCTGAAGATGACCATCAGCCAGCAAG  805
            .||||||||..||||||||||         ||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  741  AATTGCTACACCTGGGACTGAAGGTGAAAGAGACTCGGATGACGCCCTACTGAAGATGACCATCAACCAGCAGG  814

Query  806  AGTTTGGCCGCACTGGGCTTCCTGACCTAAGCAGTATGACTGAGGAAGAGCAGATTGCTTATGCCATGCAGATG  879
            ||||||||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  815  AGTTTGGCCGTCCTGGGCTTCCAGACCTAAGCAGCATGACTGAGGAAGAGCAGATCGCCTACGCCATGCAGATG  888

Query  880  TCCCTGCAGGGAGCAGAGTTTGGCCAGGCGGAATCAGCAGACATTGATGCCAGCTCAGCTATGGACACATCTGA  953
            ||||||||||||.||||||||.||||   .|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  TCCCTGCAGGGAACAGAGTTTAGCCA---AGAATCGGCTGACATGGATGCCAGCTCAGCCATGGACACATCTGA  959

Query  954  GCCAGCCAAGGAGGAGGATGATTACGACGTGATGCAGGACCCCGAGTTCCTTCAGAGTGTCCTAGAGAACCTCC  1027
            .||||.|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  960  TCCAGTCAAGGAGGAGGATGACTATGACGTCATGCAGGACCCGGAGTTCCTTCAGAGCGTCCTAGAGAACCTTC  1033

Query 1028  CAGGTGTGGATCCCAACAATGAAGCCATTCGAAATGCTATGGGCTCCCTGGCCTCCCAGGCCACCAAGGACGGC  1101
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||..|.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1034  CAGGTGTGGATCCCAACAATGCAGCCATTCGAAGTGTCATGGGGGCTCTGGCCTCCCAGGCCACCAAGGATGGC  1107

Query 1102  AAGAAGGACAAGAAGGAGGAAGACAAGAAG  1131
            |||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1108  AAGAATGACAAGAAAGAGGAAGAGAAGAAG  1137